Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Rab21P35282 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Rab21P35282 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Rab21P35282 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Rab21P35282 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Rab21P35282 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Rab21P35282 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Rab21P35282 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Rab21P35282 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Rab21P35282 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Rab21P35282 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Rab21P35282 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Rab21P35282 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Rab21P35282 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Rab21P35282 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rab21P35282 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rab21P35282 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Rab21P35282 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rab21P35282 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rab21P35282 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rab21P35282 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rab21P35282 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Rab21P35282 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rab21P35282 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rab21P35282 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Rab21P35282 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rab21P35282 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rab21P35282 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rab21P35282 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rab21P35282 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rab21P35282 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rab21P35282 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Rab21P35282 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Rab21P35282 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Rab21P35282 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rab21P35282 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Rab21P35282 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rab21P35282 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rab21P35282 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rab21P35282 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Rab21P35282 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rab21P35282 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Rab21P35282 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Rab21P35282 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Rab21P35282 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rab21P35282 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rab21P35282 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rab21P35282 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rab21P35282 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Rab21P35282 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Rab21P35282 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rab21P35282 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Rab21P35282 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rab21P35282 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rab21P35282 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rab21P35282 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rab21P35282 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rab21P35282 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rab21P35282 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Rab21P35282 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Rab21P35282 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Rab21P35282 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rab21P35282 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Rab21P35282 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Rab21P35282 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rab21P35282 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rab21P35282 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rab21P35282 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Rab21P35282 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rab21P35282 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rab21P35282 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rab21P35282 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Rab21P35282 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Rab21P35282 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Rab21P35282 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Rab21P35282 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Rab21P35282 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Rab21P35282 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Rab21P35282 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Rab21P35282 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Rab21P35282 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Rab21P35282 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rab21P35282 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rab21P35282 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rab21P35282 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rab21P35282 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rab21P35282 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rab21P35282 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rab21P35282 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Rab21P35282 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rab21P35282 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rab21P35282 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rab21P35282 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rab21P35282 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rab21P35282 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rab21P35282 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rab21P35282 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Rab21P35282 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rab21P35282 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rab21P35282 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms