Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Atl2Q6PA06 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atl2Q6PA06 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atl2Q6PA06 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Atl2Q6PA06 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Atl2Q6PA06 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Atl2Q6PA06 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Atl2Q6PA06 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Atl2Q6PA06 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atl2Q6PA06 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atl2Q6PA06 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Atl2Q6PA06 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atl2Q6PA06 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atl2Q6PA06 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Atl2Q6PA06 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Atl2Q6PA06 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Atl2Q6PA06 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Atl2Q6PA06 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Atl2Q6PA06 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Atl2Q6PA06 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atl2Q6PA06 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Atl2Q6PA06 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Atl2Q6PA06 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Atl2Q6PA06 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Atl2Q6PA06 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atl2Q6PA06 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atl2Q6PA06 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atl2Q6PA06 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atl2Q6PA06 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atl2Q6PA06 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atl2Q6PA06 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atl2Q6PA06 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Atl2Q6PA06 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atl2Q6PA06 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atl2Q6PA06 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atl2Q6PA06 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atl2Q6PA06 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atl2Q6PA06 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atl2Q6PA06 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atl2Q6PA06 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atl2Q6PA06 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atl2Q6PA06 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atl2Q6PA06 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atl2Q6PA06 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atl2Q6PA06 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Atl2Q6PA06 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atl2Q6PA06 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atl2Q6PA06 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Atl2Q6PA06 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Atl2Q6PA06 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Atl2Q6PA06 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atl2Q6PA06 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atl2Q6PA06 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atl2Q6PA06 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atl2Q6PA06 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atl2Q6PA06 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atl2Q6PA06 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atl2Q6PA06 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atl2Q6PA06 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atl2Q6PA06 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atl2Q6PA06 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atl2Q6PA06 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Atl2Q6PA06 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Atl2Q6PA06 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Atl2Q6PA06 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atl2Q6PA06 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atl2Q6PA06 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atl2Q6PA06 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atl2Q6PA06 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atl2Q6PA06 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atl2Q6PA06 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atl2Q6PA06 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atl2Q6PA06 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atl2Q6PA06 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atl2Q6PA06 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atl2Q6PA06 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atl2Q6PA06 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atl2Q6PA06 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atl2Q6PA06 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atl2Q6PA06 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atl2Q6PA06 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atl2Q6PA06 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atl2Q6PA06 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atl2Q6PA06 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atl2Q6PA06 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atl2Q6PA06 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atl2Q6PA06 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Atl2Q6PA06 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atl2Q6PA06 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atl2Q6PA06 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atl2Q6PA06 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atl2Q6PA06 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atl2Q6PA06 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atl2Q6PA06 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atl2Q6PA06 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atl2Q6PA06 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atl2Q6PA06 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atl2Q6PA06 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atl2Q6PA06 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atl2Q6PA06 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms