Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Timm44O35857 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Timm44O35857 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Timm44O35857 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Timm44O35857 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Timm44O35857 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Timm44O35857 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Timm44O35857 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Timm44O35857 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Timm44O35857 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Timm44O35857 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Timm44O35857 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Timm44O35857 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Timm44O35857 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Timm44O35857 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Timm44O35857 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Timm44O35857 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Timm44O35857 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Timm44O35857 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Timm44O35857 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Timm44O35857 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Timm44O35857 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Timm44O35857 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Timm44O35857 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Timm44O35857 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Timm44O35857 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Timm44O35857 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Timm44O35857 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Timm44O35857 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Timm44O35857 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Timm44O35857 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Timm44O35857 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Timm44O35857 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Timm44O35857 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Timm44O35857 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Timm44O35857 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Timm44O35857 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Timm44O35857 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Timm44O35857 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Timm44O35857 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Timm44O35857 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Timm44O35857 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Timm44O35857 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Timm44O35857 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Timm44O35857 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Timm44O35857 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Timm44O35857 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Timm44O35857 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Timm44O35857 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Timm44O35857 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Timm44O35857 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Timm44O35857 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Timm44O35857 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Timm44O35857 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Timm44O35857 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Timm44O35857 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Timm44O35857 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Timm44O35857 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Timm44O35857 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Timm44O35857 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Timm44O35857 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Timm44O35857 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Timm44O35857 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Timm44O35857 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Timm44O35857 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Timm44O35857 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Timm44O35857 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Timm44O35857 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Timm44O35857 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Timm44O35857 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Timm44O35857 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Timm44O35857 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Timm44O35857 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Timm44O35857 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Timm44O35857 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Timm44O35857 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Timm44O35857 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Timm44O35857 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Timm44O35857 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Timm44O35857 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Timm44O35857 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Timm44O35857 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Timm44O35857 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Timm44O35857 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Timm44O35857 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Timm44O35857 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Timm44O35857 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Timm44O35857 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Timm44O35857 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Timm44O35857 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Timm44O35857 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Timm44O35857 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Timm44O35857 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Timm44O35857 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Timm44O35857 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Timm44O35857 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Timm44O35857 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Timm44O35857 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Timm44O35857 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Timm44O35857 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
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