Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFH3

Dcaf15, DDB1- and CUL4-associated factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf15Q6PFH3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,31■■■■■ 4,84
Dcaf15Q6PFH3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,98■■■■■ 4,31
Dcaf15Q6PFH3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
Dcaf15Q6PFH3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,43■■■■□ 3,9
Dcaf15Q6PFH3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,31■■■■□ 3,88
Dcaf15Q6PFH3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,49■■■■□ 3,75
Dcaf15Q6PFH3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Dcaf15Q6PFH3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Dcaf15Q6PFH3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Dcaf15Q6PFH3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Dcaf15Q6PFH3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Dcaf15Q6PFH3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Dcaf15Q6PFH3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Dcaf15Q6PFH3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Dcaf15Q6PFH3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,74■■■■□ 3,47
Dcaf15Q6PFH3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Dcaf15Q6PFH3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Dcaf15Q6PFH3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Dcaf15Q6PFH3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Dcaf15Q6PFH3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Dcaf15Q6PFH3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Dcaf15Q6PFH3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Dcaf15Q6PFH3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Dcaf15Q6PFH3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Dcaf15Q6PFH3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,92■■■■□ 3,34
Dcaf15Q6PFH3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Dcaf15Q6PFH3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Dcaf15Q6PFH3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Dcaf15Q6PFH3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
Dcaf15Q6PFH3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Dcaf15Q6PFH3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Dcaf15Q6PFH3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Dcaf15Q6PFH3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,27■■■■□ 3,24
Dcaf15Q6PFH3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Dcaf15Q6PFH3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Dcaf15Q6PFH3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Dcaf15Q6PFH3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Dcaf15Q6PFH3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Dcaf15Q6PFH3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Dcaf15Q6PFH3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Dcaf15Q6PFH3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Dcaf15Q6PFH3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Dcaf15Q6PFH3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Dcaf15Q6PFH3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,51■■■■□ 3,12
Dcaf15Q6PFH3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Dcaf15Q6PFH3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Dcaf15Q6PFH3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Dcaf15Q6PFH3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Dcaf15Q6PFH3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Dcaf15Q6PFH3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Dcaf15Q6PFH3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Dcaf15Q6PFH3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Dcaf15Q6PFH3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Dcaf15Q6PFH3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Dcaf15Q6PFH3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Dcaf15Q6PFH3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Dcaf15Q6PFH3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Dcaf15Q6PFH3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,82■■■■□ 3
Dcaf15Q6PFH3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Dcaf15Q6PFH3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Dcaf15Q6PFH3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Dcaf15Q6PFH3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Dcaf15Q6PFH3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Dcaf15Q6PFH3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Dcaf15Q6PFH3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Dcaf15Q6PFH3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Dcaf15Q6PFH3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Dcaf15Q6PFH3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Dcaf15Q6PFH3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Dcaf15Q6PFH3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Dcaf15Q6PFH3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Dcaf15Q6PFH3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Dcaf15Q6PFH3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Dcaf15Q6PFH3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Dcaf15Q6PFH3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Dcaf15Q6PFH3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Dcaf15Q6PFH3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Dcaf15Q6PFH3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Dcaf15Q6PFH3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Dcaf15Q6PFH3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Dcaf15Q6PFH3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Dcaf15Q6PFH3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Dcaf15Q6PFH3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Dcaf15Q6PFH3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Dcaf15Q6PFH3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Dcaf15Q6PFH3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Dcaf15Q6PFH3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Dcaf15Q6PFH3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Dcaf15Q6PFH3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Dcaf15Q6PFH3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Dcaf15Q6PFH3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Dcaf15Q6PFH3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,82■■■□□ 2,84
Dcaf15Q6PFH3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Dcaf15Q6PFH3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Dcaf15Q6PFH3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Dcaf15Q6PFH3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Dcaf15Q6PFH3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Dcaf15Q6PFH3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Dcaf15Q6PFH3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Dcaf15Q6PFH3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms