RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	MGA1	P53050	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YNR066C	P53752	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SWS2	P53937	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MEH1	Q02205	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	ADD37	Q03233	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	CTR3	Q06686	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MED4	Q12343	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	POP5	P28005	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	AFG1	P32317	509 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	OM14	P38325	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SLM6	P38343	150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PHS1	P40857	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	IKS1	P47042	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	VPS28	Q02767	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	BNA5	Q05979	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RAD28	Q12021	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SPS4	P09937	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SSS1	P35179	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SRX1	P36077	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MRPL15	P36523	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MRPS9	P38120	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YBR013C	P38215	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	WSS1	P38838	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SUR2	P38992	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	POP2	P39008	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SLM1	P40485	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MOB2	P43563	287 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	CIS3	P47001	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	GWT1	P47026	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YJL016W	P47072	561 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	ERG25	P53045	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YGL262W	P53054	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	ERV14	P53173	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	GMC1	Q04399	608 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	FRE7	Q12333	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SPO7	P18410	259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	ELO2	P25358	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	ERV1	P27882	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	HSP150	P32478	413 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	FLX1	P40464	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YIL086C	P40503	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SPG5	P42933	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	BNS1	P50084	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	OCA2	P53949	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	HHT1	P61830	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	AVO2	Q04749	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SEI1	Q06058	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	HMS1	Q12398	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PEX4	P29340	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YHR210C	P38893	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MBB1	P39534	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	ATG27	P46989	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YJR012C	P47087	207 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YGR149W	P48236	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	AVT4	P50944	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YGL185C	P53100	379 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YGL114W	P53134	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YNL234W	P53857	426 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SKO1	Q02100	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	DIC1	Q06143	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CTS2	Q06350	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	POS5	Q06892	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	GRE1	Q08969	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	DCN1	Q12395	269 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	IZH2	Q12442	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	LSB5	P25369	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU3	P25610	124 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms