RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	PRO1	P32264	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SPS18	P32572	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	UTR5	P32630	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	LCB3	P47013	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	COQ5	P49017	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	WSC2	P53832	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	HSK3	P69852	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	GRX5	Q02784	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	COQ11	Q05892	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	CTR3	Q06686	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YCR102C	P25608	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	COX13	P32799	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TRS20	P38334	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	MET30	P39014	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YJL193W	P39542	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SAS2	P40963	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YFL065C	P43539	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TRI1	Q05024	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	NAT3	Q06504	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ENB1	Q08299	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	PEX11	Q12462	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TRX3	P25372	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	CLB6	P32943	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
VBA1	YMR088C	AVT2	P39981	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	DLS1	P40366	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	XBP1	P40489	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	VEL1	P53058	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SDC1	Q03323	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	NUP53	Q03790	475 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SOR2	Q07786	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	IML1	P47170	1584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
VBA1	YMR088C	ERG8	P24521	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SKN1	P33336	771 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TRR2	P38816	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YHR177W	P38867	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YEA4	P40004	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	APQ12	P40532	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YFR045W	P43617	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	MSY1	P48527	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	CDC14	Q00684	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	UPS1	Q05776	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	FRE7	Q12333	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VBA1	YMR088C	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	SIR2	P06700	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PEX34	P25584	144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	NDT80	P38830	627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	TEM1	P38987	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YEL076C	P39971	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	PAM16	P42949	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	OST2	P46964	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	RIM8	P53179	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YGR039W	P53225	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	FCY1	Q12178	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VBA1	YMR088C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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