RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C PER33Q12144 273 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PST2Q12335 198 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YMR030W-AQ3E760 96 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CMC2Q3E7A4 109 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YRF1-3P0CX14 1859 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YRF1-7P0CX15 1859 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YRF1-6P53819 1859 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C FLO1P32768 1537 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C FIG2P25653 1609 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MOT1P32333 1867 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SPS2P08459 502 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RPL4AP10664 362 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SPT14P32363 452 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PTM1P32857 523 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SFC1P33303 322 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YPT52P36018 234 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CAF4P36130 643 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ECM31P38122 312 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YHR045WP38775 560 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NSG1P38837 291 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C HPA3P39979 161 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C COG3P40094 801 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C FMC1P40491 155 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GON7P46984 123 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MCM22P47167 239 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C UBC12P52491 188 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NIF3P53081 288 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YGR026WP53217 278 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data1.63□□□□□ -2.15not detected
CSE4YKL049C LSM7P53905 115 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GRX5Q02784 150 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PRM15Q03262 622 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YMR279CQ03263 540 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YMD8Q03697 442 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YDR249CQ03787 373 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YDR124WQ04608 324 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YLR413WQ06689 675 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YPD1Q07688 167 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SLD7Q08457 257 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YLR126CQ12288 251 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SMT3Q12306 101 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C DCN1Q12395 269 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YHR213W-AQ8TGT4 77 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RIB3Q99258 208 aa1.63□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PMD1P32634 1753 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C REP2P03872 296 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SSA3P09435 649 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SCO1P23833 295 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C POF1P25576 258 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C DAL80P26343 269 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NVJ1P38881 321 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C AIM18P38884 321 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RFC4P40339 323 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C COA1P40452 197 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ERG10P41338 398 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRX5P47007 382 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C JHD2P47156 728 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C DAN1P47178 298 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C BOL2P53082 120 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRH4P53166 561 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PRM8P53174 237 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C TIM21P53220 239 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CDC14Q00684 551 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SPP2Q02521 185 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ARL3Q02804 198 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RRN5Q02983 363 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ATG38Q05789 226 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YLR283WQ05867 314 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ARV1Q06541 321 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YOL107WQ12239 342 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RDI1Q12434 202 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SNF8Q12483 233 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YPL247CQ12523 523 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YGL194C-AQ2V2P6 80 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PCC1Q3E833 88 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YCL001W-BQ96VH2 84 aa1.62□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C HKR1P41809 1802 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C UBR2Q07963 1872 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CNB1P25296 175 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PEX34P25584 144 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C HOM6P31116 359 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SSS1P35179 80 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C TMA19P35691 167 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data1.61□□□□□ -2.15not detected
CSE4YKL049C YKL070WP36087 169 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PRS2P38620 318 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RPS20P38701 121 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C TEM1P38987 245 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YEL028WP39989 153 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C HMF1P40037 129 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PGD1P40356 397 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GTT1P40582 234 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NSE4P43124 402 aa1.61□□□□□ -2.15
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