RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	EMC5	P40540	141 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YMR279C	Q03263	540 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RIM9	Q04734	239 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	UPS1	Q05776	175 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CRR1	Q05790	422 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	GAT3	Q07928	141 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	FCY22	Q12119	530 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	COA2	Q3E823	68 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ZRC1	P20107	442 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	PCL7	P40186	285 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	GON7	P46984	123 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	XPT1	P47165	209 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SUR7	P54003	302 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ASM4	Q05166	528 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ATG5	Q12380	294 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	TRA1	P38811	3744 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CNB1	P25296	175 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SRB6	P32570	121 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CUE1	P38428	203 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RMD6	P39975	231 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	HOF1	Q05080	669 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YFH1	Q07540	174 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YOR292C	Q08743	309 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YOX1	P34161	385 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YUH1	P35127	236 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YKL162C	P36052	402 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CRZ1	P53968	678 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	HSK3	P69852	69 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ACS1	Q01574	713 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YMR082C	Q04276	118 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	GMC1	Q04399	608 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	COX17	Q12287	69 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	TEL1	P38110	2787 aa		5.15	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RPL39	P04650	51 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YML003W	P0CF16	290 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YBR220C	P38318	560 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YHL037C	P38733	133 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YEA4	P40004	342 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	CAF16	P43569	289 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YJR056C	P47115	236 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YGL262W	P53054	175 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	WSC2	P53832	503 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	APJ1	P53940	528 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YPL067C	Q02754	198 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ADD37	Q03233	198 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	RFM1	Q12192	310 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	RPS23B	P0CX30	145 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YCR025C	P25352	136 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ERV1	P27882	189 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	LDS1	P31379	325 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	MSK1	P32048	576 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SLM6	P38343	150 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PRM5	P40476	318 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YCL001W-A	P87012	153 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SED1	Q01589	338 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YOR015W	Q12169	119 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YOR029W	Q12243	111 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	DGK1	Q12382	290 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PCC1	Q3E833	88 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ELO2	P25358	347 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ECM25	P32525	599 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	REC104	P33323	182 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ECM31	P38122	312 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	TOK1	P40310	691 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	GEP7	P53171	287 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SNO1	Q03144	224 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YOL029C	Q08187	201 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	COX19	Q3E731	98 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ADE8	P04161	214 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	IKI1	P38874	309 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	FLO5	P38894	1075 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SLM1	P40485	686 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YIL024C	P40543	189 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	BNA2	P47125	453 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	LIP2	Q06005	328 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YDL242W	Q07746	117 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PAM18	Q07914	168 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PRR2	Q12310	699 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	AGC1	Q12482	902 aa		5.12	□□□□□ -1.59

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