RNA–Protein interactions for RNA: YHR129C

ARP1, Transcript of Actin-related protein of the dynactin complex, yeast

Gene ARP1, Length 1,155 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP1	YHR129C	TPC1	P53257	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	MRX8	Q05473	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	CCA1	P21269	546 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	SEC17	P32602	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	OAR1	P35731	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	CSH1	P38287	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	TRS20	P38334	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	SCS3	P53012	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YNL234W	P53857	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	VPS28	Q02767	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	INP1	Q03694	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	BNR1	P40450	1375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	TIR1	P10863	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	TKL2	P33315	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	AVT7	P40501	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	CAT5	P41735	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	RRT5	P43607	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YGL082W	P53155	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	APJ1	P53940	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	SAS5	Q99314	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	SPS2	P08459	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	ATS1	P31386	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	RNP1	P32385	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	SFT1	P43682	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	RPE1	P46969	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	COS10	P52924	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	AAH1	P53909	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	DAD3	P69850	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	MIM1	Q08176	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	SPC3	Q12133	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP1	YHR129C	MET5	P47169	1442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	URA10	P30402	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	SRP21	P32342	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YBR063C	P38083	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	RPO31	P04051	1460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	Q0255	P03881	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	ANB1	P19211	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	MOH1	P38191	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	FIP1	P45976	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YGL088W	P53151	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	FMP48	P53233	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YLR462W	O13556	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YHR140W	P38842	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	GGC1	P38988	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	TIM17	P39515	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YEA6	P39953	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YEL075C	P39972	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YER189W	P40104	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	GPI2	P46961	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	VPS25	P47142	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	TTI2	P47168	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YGL230C	P53074	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YNL033W	P53964	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YNL019C	P53975	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	VHS1	Q03785	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	NAT3	Q06504	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	BSC1	Q12140	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YPS3	Q12303	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	OCA6	Q12454	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	PRM5	P40476	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YIL024C	P40543	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	CCH1	P50077	2039 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP1	YHR129C	YCR025C	P25352	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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