RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B KNH1P50112 268 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B UBC13P52490 153 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B USE1P53146 245 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B VPS60Q03390 229 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B LPP1Q04396 274 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B KAP95Q06142 861 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B KEI1Q06346 221 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B OCA6Q12454 224 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B NHP6BP11633 99 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SNF4P12904 322 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B HOM6P31116 359 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YHR140WP38842 239 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YER076CP40049 302 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B UFE1P41834 346 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B AGX1P43567 385 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B FAR3P46671 204 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YNL010WP53981 241 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YDR476CQ03362 224 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B PRM6Q04705 352 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YPL191CQ08930 360 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YDR018CQ12185 396 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SPP41P38904 1435 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YOL163WP0CF20 169 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B DCC1P25559 380 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RPL5P26321 297 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B AGP3P43548 558 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YPT32P51996 222 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YGR017WP53210 297 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YLR460CP54007 376 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B BRE1Q07457 700 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B NIP7Q08962 181 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B APC9Q12107 265 aa-0.84□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SEM1O94742 89 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RPL6BP05739 176 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B HSC82P15108 705 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MER1P16523 270 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B PET18P25362 215 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SPT14P32363 452 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B TVP38P36164 337 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MNN9P39107 395 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B PEP8P40335 379 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MGA1P53050 456 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B AIM34Q03673 198 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YDL241WQ07738 123 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CMC4Q3E7A9 73 aa-0.85□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B POL30P15873 258 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SEC14P24280 304 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B BUB2P26448 306 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B IMP2'P32351 346 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B STN1P38960 494 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B VAB2P40003 282 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PDS1P40316 373 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YJL218WP40892 196 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YFR035CP43608 114 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GPI8P49018 411 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B APT1P49435 187 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B HMO1Q03973 246 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ECM19Q06011 112 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SRL2Q12020 392 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RIO1Q12196 484 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YLR236CA0A023PZG4 107 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPL25P04456 142 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RAD6P06104 172 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ARO7P32178 256 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RPT5P33297 434 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SFK1P35735 353 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PHO90P39535 881 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B BTT1P40314 149 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B CSM2P40465 213 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data-0.85□□□□□ -2.55not detected
YHL009W-BYHL009W-B VOA1P53262 265 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.85□□□□□ -2.55not detected
YHL009W-BYHL009W-B GPN3Q06543 272 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YPR078CQ06813 372 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.85□□□□□ -2.55not detected
YHL009W-BYHL009W-B VMA6P32366 345 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YET1P35723 206 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B AIM29P36154 155 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GDT1P38301 280 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B HYR1P40581 163 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YKE2P52553 114 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B EDC1P53080 175 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B YPR127WQ06494 345 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B BUG1Q12191 341 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PSY3Q12318 242 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B RMD5Q12508 421 aa-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B SEC16P48415 2195 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B PFY1P07274 126 aa-0.86□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B TRR1P29509 319 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B NTG1P31378 399 aa-0.86□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B GCG1P32656 232 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B ECM33P38248 429 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
YHL009W-BYHL009W-B POR2P40478 281 aa-0.86□□□□□ -2.55
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