RNA–Protein interactions for RNA: YGL158W

RCK1, Transcript of Protein kinase involved in the response to oxidative stress, yeast

Gene RCK1, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK1	YGL158W	BMT2	P38278	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	NSG1	P38837	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SWS2	P53937	143 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ADD37	Q03233	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MRX4	Q12467	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	PSF1	Q12488	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	PHO2	P07269	559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	STE18	P18852	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	EPT1	P22140	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	VPS51	P36116	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	TIM17	P39515	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SDS23	P53172	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YML018C	Q03730	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SRB6	P32570	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YBL010C	P32788	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	GPX1	P36014	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SOL2	P37262	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SHE1	P38200	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	GTT1	P40582	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RPE1	P46969	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ASI3	P53983	676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MET31	Q03081	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MHR1	Q06630	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ERD2	P18414	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	AHC2	P25649	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	TIP20	P33891	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SEN34	P39707	275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ERG28	P40030	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YGR201C	P42936	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	CIS3	P47001	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YGR026W	P53217	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	VPS68	Q12016	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YCT1	Q12235	531 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	DGK1	Q12382	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MHT1	Q12525	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YPR096C	O13587	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	QCR7	P00128	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YMR31	P19955	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	CDC50	P25656	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SFC1	P33303	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
RCK1	YGL158W	MIG3	P39943	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YNL140C	P53910	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	RNH201	P53942	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PLB3	Q08108	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YPK2	P18961	677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	APA2	P22108	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	IKI1	P38874	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	MOG1	P47123	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YGL260W	P53056	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	BOR1	P53838	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YML096W	Q04489	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	NNT1	Q05874	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	MMT2	Q08970	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ATG41	Q12048	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PPH21	P23594	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	RMD6	P39975	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	COX15	P40086	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	AIM25	P47140	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ELP6	Q04868	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SRY1	P36007	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	AIM2	P39721	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YEL073C	P39974	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PGD1	P40356	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	BMT5	P40493	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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