RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDI1	YER143W	IKI1	P38874	309 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	PCL7	P40186	285 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	RFC2	P40348	353 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.39	□□□□□ -1.23	not detected
DDI1	YER143W	YGL117W	P53133	265 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	GEP7	P53171	287 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	GPI15	P53961	229 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YOL029C	Q08187	201 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ATG31	Q12421	196 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	MRPL33	P20084	86 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SPS18	P32572	300 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YEA6	P39953	335 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	AGX1	P43567	385 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ECM18	Q04623	453 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ATP14	Q12349	124 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	COA2	Q3E823	68 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ROX3	P25046	220 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	COQ2	P32378	372 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	RPD3	P32561	433 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ALG14	P38242	237 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SSO2	P39926	295 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	UBC12	P52491	188 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SBH2	P52871	88 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	WSC2	P53832	503 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	INN1	P53901	409 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ATP10	P18496	279 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	LSB5	P25369	354 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ISC10	P32645	267 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YKL162C	P36052	402 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YIL012W	P40551	113 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	NCA3	P46955	337 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YJL118W	P47022	219 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	TTI2	P47168	421 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	DID2	P69771	204 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	HRD1	Q08109	551 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ATG5	Q12380	294 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YBR085C-A	O43137	85 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YMR31	P19955	123 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	APA2	P22108	325 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	PKP2	P53170	491 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YNR064C	P53750	290 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	TIM10	P87108	93 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YMR082C	Q04276	118 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	YFH1	Q07540	174 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	PAM18	Q07914	168 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	BPH1	P25356	2167 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	ERV1	P27882	189 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	GPI18	P38211	433 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SLM6	P38343	150 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	HOF1	Q05080	669 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	SOR2	Q07786	357 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDI1	YER143W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YIR020C	P40575	100 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	SRB7	P47822	140 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	BUL1	P48524	976 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	TIM44	Q01852	431 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YPL264C	Q08980	353 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YDL009C	Q12210	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	VPS63	O13549	108 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	SIP1	P32578	815 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	IES6	P32617	166 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YEA4	P40004	342 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	PHO23	P50947	330 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YGR050C	P53231	118 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	LPP1	Q04396	274 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YPD1	Q07688	167 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YCR025C	P25352	136 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	FSH2	Q05015	223 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	PRR2	Q12310	699 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DDI1	YER143W	YOS1	Q3E834	85 aa		7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53 ms