RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 KIF12Q96FN5 646 aa22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 SNX27Q96L92 541 aa22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 DPP3Q9NY33 737 aa22.88■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 M0QZ92 97 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 KCNK3O14649 394 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CD58P19256 250 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 DNA2P51530 1060 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CAP1Q01518 475 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 SNTG2Q9NY99 539 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 WEE2P0C1S8 567 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 APLP1P51693 650 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 NUP85Q9BW27 656 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 EPC1Q9H2F5 836 aa22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 NOMO3P69849 1222 aa22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 NAA35Q5VZE5 725 aa22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 SESTD1Q86VW0 696 aa22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 HPDLQ96IR7 371 aa22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 POLIQ9UNA4 740 aa22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.86■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM170AA1A519 330 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 HMGCRP04035 888 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ELNP15502 786 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 RAB21Q9UL25 225 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 TRIP11Q15643 1979 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 TRPA1O75762 1119 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 GNRH1P01148 92 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MAP2K2P36507 400 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 C2orf54Q08AI8 447 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 LIN9Q5TKA1 542 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MON1BQ7L1V2 547 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 RPAINQ86UA6 219 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 TTC39CQ8N584 583 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CNTN3Q9P232 1028 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ALG6Q9Y672 507 aa22.85■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ASGR1P07306 291 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 PAEPP09466 180 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CLCN6P51797 869 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 BRD3Q15059 726 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 KCNA10Q16322 511 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 SERINC5Q86VE9 423 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MS4A14Q96JA4 679 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.84■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 RECQL4O94761 1208 aa22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 MYO1EQ12965 1108 aa22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 ZBTB6Q15916 424 aa22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 BEST2Q8NFU1 509 aa22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.83■■□□□ 1.25
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC151A5D8V7 595 aa22.82■■□□□ 1.24
RHBDD2-201ENST00000006777 PTPROQ16827 1216 aa22.82■■□□□ 1.24
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF394Q53GI3 561 aa22.82■■□□□ 1.24
RHBDD2-201ENST00000006777 UBXN11Q5T124 520 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms