RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	PPX1	P38698	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	SWI5	P08153	709 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	YHL050C	P38721	697 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	YHR219W	P38900	624 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	IPL1	P38991	367 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	RTT106	P40161	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TRZ1	YKR079C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	BCK2	P33306	851 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	ACF4	P47129	309 aa		4.09	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	STE6	P12866	1290 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	YBL086C	P38177	466 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	MDJ2	P42834	146 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	SUV3	P32580	737 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	QDR1	P40475	563 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	SPR3	P41901	512 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	WTM2	Q12206	467 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	MCM1	P11746	286 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	HED1	Q03937	162 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	DFG5	Q05031	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	BDS1	Q08347	646 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	AMS1	P22855	1083 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	NUT2	Q06213	157 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	XDJ1	P39102	459 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	ISC10	P32645	267 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	YBR197C	P38306	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	CAB1	Q04430	367 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	SCD5	P34758	872 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	THI12	P42883	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	THI5	P43534	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	THI11	P47183	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	THI13	Q07748	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	SUM1	P46676	1062 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	POL32	P47110	350 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	APC11	Q12157	165 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	WHI5	Q12416	295 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	FRT1	Q99332	602 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	UFD2	P54860	961 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TRZ1	YKR079C	HXT5	P38695	592 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	CDC4	P07834	779 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	MRPL33	P20084	86 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	RPB10	P22139	70 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	MGE1	P38523	228 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	MET10	P39692	1035 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	MET32	Q12041	191 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	SVF1	Q05515	481 aa		4	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	ARG82	P07250	355 aa		4	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	UGA3	P26370	528 aa		4	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	ALD2	P47771	506 aa		4	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	AIM44	Q99299	758 aa		4	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	ATE1	P16639	503 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	HST3	P53687	447 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	AFT1	P22149	690 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	MET4	P32389	672 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	SMC1	P32908	1225 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	AAD14	P42884	376 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	YJR107W	P47145	328 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	CLA4	P48562	842 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	YTA6	P40328	754 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	MSN5	P52918	1224 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	STB3	Q12427	513 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	VMA3	P25515	160 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	LDH1	P38139	375 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	DYS1	P38791	387 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	KTR2	P33550	425 aa		3.96	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	HXT8	P40886	569 aa		3.96	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	JJJ2	P46997	583 aa		3.96	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
TRZ1	YKR079C	RAS1	P01119	309 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	ASH1	P34233	588 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	CDC55	Q00362	526 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	MNL2	Q12205	849 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	MLF3	P32047	452 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	SEC8	P32855	1065 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	SSN3	P39073	555 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	GPI13	Q07830	1017 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	YBR287W	P38355	427 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	VTC4	P47075	721 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TRZ1	YKR079C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.9 ms