RNA–Protein interactions for RNA: YHR040W

BCD1, Essential protein required for the accumulation of box C/D snoRNA, yeast

Gene BCD1, Length 1,101 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCD1	YHR040W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	SRB8	P25648	1427 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	BIO2	P32451	375 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	IXR1	P33417	597 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	NUP159	P40477	1460 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	MET5	P47169	1442 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	VAC17	P25591	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	GUT2	P32191	649 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	SLX8	P40072	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	ATG32	P40458	529 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	HED1	Q03937	162 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BCD1	YHR040W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	FIG4	P42837	879 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	SCT1	P32784	759 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	YPP1	P46951	817 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	CLA4	P48562	842 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	ISF1	P32488	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	PAF1	P38351	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	EMP47	P43555	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	MCM16	Q12262	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	PDR10	P51533	1564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	BUD3	P25558	1636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	CDC4	P07834	779 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	MRX12	P47084	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	HST3	P53687	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	FRA1	Q07825	749 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	ENV9	Q08651	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	TRK1	P12685	1235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	ATG3	P40344	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	APP1	P53933	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	IOC4	Q04213	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BCD1	YHR040W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	ASH1	P34233	588 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	RIM21	P48565	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	MET32	Q12041	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	YBT1	P32386	1661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	UGA3	P26370	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	ATG20	Q07528	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	AFT1	P22149	690 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	MKS1	P34072	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	SLD2	P34252	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	BNR1	P40450	1375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	MRX10	Q05648	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	GCN2	P15442	1659 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	SIS2	P36024	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	SOH1	P38633	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	GCR2	Q01722	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	SRF1	Q12516	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	FBP26	P32604	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	YBL086C	P38177	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BCD1	YHR040W	DRS2	P39524	1355 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BCD1	YHR040W	SPO14	P36126	1683 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BCD1	YHR040W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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