RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W BRL1P38770 471 aa6.92□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data6.92□□□□□ -1.3not detected
NSE4YDL105W SKN7P38889 622 aa6.91□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W ATG3P40344 310 aa6.91□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W ALA1P40825 983 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W SUM1P46676 1062 aa6.91□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W UTP7P40055 554 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W YMR187CQ03236 431 aa6.9□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W TDA6Q06466 467 aa6.9□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W SBE2P42223 864 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W YPP1P46951 817 aa6.88□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W JJJ2P46997 583 aa6.88□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W IRE1P32361 1115 aa6.87□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W FPS1P23900 669 aa6.86□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W SLX8P40072 274 aa6.86□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W YNR014WP53719 212 aa6.86□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W TFB3Q03290 321 aa6.86□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W SOH1P38633 127 aa6.84□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W HDA3Q06623 655 aa6.84□□□□□ -1.31
NSE4YDL105W MET1P36150 593 aa6.81□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W MRPL16P38064 232 aa6.8□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W BOI2P39969 1040 aa6.8□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W PKC1P24583 1151 aa6.79□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W PDC6P26263 563 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W PSH1Q12161 406 aa6.79□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W STB3Q12427 513 aa6.78□□□□□ -1.32
NSE4YDL105W SUP45P12385 437 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.76□□□□□ -1.33not detected
NSE4YDL105W PDC5P16467 563 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W YCK2P23292 546 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W BIO2P32451 375 aa6.75□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W SPR3P41901 512 aa6.75□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W YPQ2Q06328 317 aa6.75□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W YDR215CQ12240 137 aa6.75□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W RPS31P05759 152 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W SWI5P08153 709 aa6.73□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W HGH1P48362 394 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W YFL034WP43564 1073 aa6.72□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W YNL108CP53929 270 aa6.72□□□□□ -1.33
NSE4YDL105W LEU1P07264 779 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W MCM1P11746 286 aa6.7□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W TAT1P38085 619 aa6.7□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W RIM21P48565 533 aa6.7□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W YTA6P40328 754 aa6.69□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W LSB6P42951 607 aa6.69□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W YJL007CP47080 104 aa6.69□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W RGP1P16664 663 aa6.66□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W MCA1Q08601 432 aa6.66□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W MSC7P38694 644 aa6.65□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W ALD2P47771 506 aa6.65□□□□□ -1.34
NSE4YDL105W NTH2P35172 780 aa6.64□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W BIM1P40013 344 aa6.62□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W YNL165WP53891 406 aa6.62□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W HEH2Q03281 663 aa6.62□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W PRY1P47032 299 aa6.61□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W MLF3P32047 452 aa6.6□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W LEO1P38439 464 aa6.6□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W YPL034WQ03083 165 aa6.6□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W TSC13Q99190 310 aa6.6□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W NHA1Q99271 985 aa6.6□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W TIF1P10081 395 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W MAC1P35192 417 aa6.59□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W ATG32P40458 529 aa6.59□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W MRX10Q05648 414 aa6.59□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W Q0182Q9ZZW1 134 aa6.59□□□□□ -1.35
NSE4YDL105W PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W RTG2P32608 588 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W CYT1P07143 309 aa6.56□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W PGM2P37012 569 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W ALG14P38242 237 aa6.56□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W NCL1P38205 684 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W PRK1P40494 810 aa6.54□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W SKP1P52286 194 aa6.54□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W MTO1P53070 669 aa6.54□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W BUD9P53226 547 aa6.54□□□□□ -1.36
NSE4YDL105W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data6.51□□□□□ -1.37 RIP-Chip
NSE4YDL105W PEP12P32854 288 aa6.51□□□□□ -1.37
NSE4YDL105W SCD5P34758 872 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.6 ms