RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616894.1

ATRNL1-210, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATRNL1, Length 1,701 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-210ENST00000616894 KIF1BO60333 1816 aa34.29■■■■□ 3.08
ATRNL1-210ENST00000616894 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
ATRNL1-210ENST00000616894 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
ATRNL1-210ENST00000616894 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
ATRNL1-210ENST00000616894 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.2■■■■□ 3.07
ATRNL1-210ENST00000616894 HRCP23327 699 aa34.2■■■■□ 3.07
ATRNL1-210ENST00000616894 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
ATRNL1-210ENST00000616894 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
ATRNL1-210ENST00000616894 BCANQ96GW7 911 aa34.18■■■■□ 3.06
ATRNL1-210ENST00000616894 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.18■■■■□ 3.06
ATRNL1-210ENST00000616894 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.17■■■■□ 3.06
ATRNL1-210ENST00000616894 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.16■■■■□ 3.06
ATRNL1-210ENST00000616894 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
ATRNL1-210ENST00000616894 CPS1P31327 1500 aa34.13■■■■□ 3.05
ATRNL1-210ENST00000616894 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.12■■■■□ 3.05
ATRNL1-210ENST00000616894 FBXO41Q8TF61 875 aa34.11■■■■□ 3.05
ATRNL1-210ENST00000616894 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.07■■■■□ 3.04
ATRNL1-210ENST00000616894 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.05■■■■□ 3.04
ATRNL1-210ENST00000616894 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ATRNL1-210ENST00000616894 PPLO60437 1756 aa34.03■■■■□ 3.04
ATRNL1-210ENST00000616894 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.02■■■■□ 3.04
ATRNL1-210ENST00000616894 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.02■■■■□ 3.04
ATRNL1-210ENST00000616894 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.01■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 RGL3Q3MIN7 710 aa34■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 DIP2AQ14689 1571 aa33.99■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa33.99■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 TBX22Q9Y458 520 aa33.99■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
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ATRNL1-210ENST00000616894 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.97■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 NWD1Q149M9 1564 aa33.97■■■■□ 3.03
ATRNL1-210ENST00000616894 IFT172Q9UG01 1749 aa33.94■■■■□ 3.02
ATRNL1-210ENST00000616894 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
ATRNL1-210ENST00000616894 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
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ATRNL1-210ENST00000616894 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 PIK3R4Q99570 1358 aa33.86■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 PTPRUQ92729 1446 aa33.85■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 METP08581 1390 aa33.84■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.84■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM94Q12767 1356 aa33.84■■■■□ 3.01
ATRNL1-210ENST00000616894 ALKQ9UM73 1620 aa33.82■■■■□ 3
ATRNL1-210ENST00000616894 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa33.79■■■■□ 3
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ATRNL1-210ENST00000616894 TOM1O60784 492 aa33.76■■■□□ 2.99
ATRNL1-210ENST00000616894 PIK3C2GO75747 1445 aa33.73■■■□□ 2.99
ATRNL1-210ENST00000616894 MYOM2P54296 1465 aa33.72■■■□□ 2.99
ATRNL1-210ENST00000616894 PIP4K2BP78356 416 aa33.71■■■□□ 2.99
ATRNL1-210ENST00000616894 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
ATRNL1-210ENST00000616894 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
ATRNL1-210ENST00000616894 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.68■■■□□ 2.98
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ATRNL1-210ENST00000616894 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.65■■■□□ 2.98
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ATRNL1-210ENST00000616894 C14orf37Q86TY3 774 aa33.63■■■□□ 2.97
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ATRNL1-210ENST00000616894 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa33.62■■■□□ 2.97
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.59■■■□□ 2.97
ATRNL1-210ENST00000616894 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
ATRNL1-210ENST00000616894 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.59■■■□□ 2.97
ATRNL1-210ENST00000616894 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.58■■■□□ 2.97
ATRNL1-210ENST00000616894 LAMC1P11047 1609 aa33.58■■■□□ 2.97
ATRNL1-210ENST00000616894 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
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ATRNL1-210ENST00000616894 PTCH1Q13635 1447 aa33.57■■■□□ 2.96
ATRNL1-210ENST00000616894 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.56■■■□□ 2.96
ATRNL1-210ENST00000616894 STK26Q9P289 416 aa33.54■■■□□ 2.96
ATRNL1-210ENST00000616894 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.54■■■□□ 2.96
ATRNL1-210ENST00000616894 C19orf44Q9H6X5 657 aa33.53■■■□□ 2.96
ATRNL1-210ENST00000616894 NALCNQ8IZF0 1738 aa33.53■■■□□ 2.96
ATRNL1-210ENST00000616894 NEUROD1Q13562 356 aa33.51■■■□□ 2.96
ATRNL1-210ENST00000616894 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
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ATRNL1-210ENST00000616894 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.49■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 HSPA1LP34931 641 aa33.48■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa33.47■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 TECPR2O15040 1411 aa33.47■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa33.47■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 SLAIN2Q9P270 581 aa33.47■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 ATF3P18847 181 aa33.46■■■□□ 2.95
ATRNL1-210ENST00000616894 ABCC11Q96J66 1382 aa33.45■■■□□ 2.95
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ATRNL1-210ENST00000616894 ADGRB1O14514 1584 aa33.44■■■□□ 2.94
ATRNL1-210ENST00000616894 DCCP43146 1447 aa33.43■■■□□ 2.94
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.43■■■□□ 2.94
ATRNL1-210ENST00000616894 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.42■■■□□ 2.94
ATRNL1-210ENST00000616894 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.42■■■□□ 2.94
ATRNL1-210ENST00000616894 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.39■■■□□ 2.94
ATRNL1-210ENST00000616894 MST1RQ04912 1400 aa33.35■■■□□ 2.93
ATRNL1-210ENST00000616894 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.33■■■□□ 2.93
ATRNL1-210ENST00000616894 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.31■■■□□ 2.92
ATRNL1-210ENST00000616894 DLC1Q96QB1 1528 aa33.3■■■□□ 2.92
ATRNL1-210ENST00000616894 SIRT1Q96EB6 747 aa33.3■■■□□ 2.92
ATRNL1-210ENST00000616894 PRAM1Q96QH2 718 aa33.29■■■□□ 2.92
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