RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TIMM44-208	ENST00000598968	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TIMM44-208	ENST00000598968	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
TIMM44-208	ENST00000598968	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.52	■■■□□ 2.96
TIMM44-208	ENST00000598968	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
TIMM44-208	ENST00000598968	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.51	■■■□□ 2.95
TIMM44-208	ENST00000598968	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
TIMM44-208	ENST00000598968	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
TIMM44-208	ENST00000598968	KIF1B	O60333	1816 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TIMM44-208	ENST00000598968	HRC	P23327	699 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TIMM44-208	ENST00000598968	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TIMM44-208	ENST00000598968	CPS1	P31327	1500 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TIMM44-208	ENST00000598968	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TIMM44-208	ENST00000598968	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TIMM44-208	ENST00000598968	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TIMM44-208	ENST00000598968	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TIMM44-208	ENST00000598968	KCNA6	P17658	529 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TIMM44-208	ENST00000598968	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TIMM44-208	ENST00000598968	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TIMM44-208	ENST00000598968	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TIMM44-208	ENST00000598968	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TIMM44-208	ENST00000598968	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TIMM44-208	ENST00000598968	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
TIMM44-208	ENST00000598968	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TIMM44-208	ENST00000598968	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
TIMM44-208	ENST00000598968	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TIMM44-208	ENST00000598968	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	PPL	O60437	1756 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	TOM1	O60784	492 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TIMM44-208	ENST00000598968	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
TIMM44-208	ENST00000598968	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TIMM44-208	ENST00000598968	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TIMM44-208	ENST00000598968	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
TIMM44-208	ENST00000598968	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
TIMM44-208	ENST00000598968	MET	P08581	1390 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TIMM44-208	ENST00000598968	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TIMM44-208	ENST00000598968	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TIMM44-208	ENST00000598968	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TIMM44-208	ENST00000598968	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TIMM44-208	ENST00000598968	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TIMM44-208	ENST00000598968	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33	■■■□□ 2.87
TIMM44-208	ENST00000598968	MSH6	P52701	1360 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TIMM44-208	ENST00000598968	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TIMM44-208	ENST00000598968	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TIMM44-208	ENST00000598968	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TIMM44-208	ENST00000598968	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TIMM44-208	ENST00000598968	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TIMM44-208	ENST00000598968	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.92	■■■□□ 2.86
TIMM44-208	ENST00000598968	MYOM2	P54296	1465 aa		32.92	■■■□□ 2.86
TIMM44-208	ENST00000598968	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	STK26	Q9P289	416 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	ATF3	P18847	181 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TIMM44-208	ENST00000598968	HSPA1L	P34931	641 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	LAMC1	P11047	1609 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TIMM44-208	ENST00000598968	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	DCC	P43146	1447 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TIMM44-208	ENST00000598968	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TIMM44-208	ENST00000598968	TECPR2	O15040	1411 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TIMM44-208	ENST00000598968	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TIMM44-208	ENST00000598968	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TIMM44-208	ENST00000598968	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TIMM44-208	ENST00000598968	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TIMM44-208	ENST00000598968	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TIMM44-208	ENST00000598968	MST1R	Q04912	1400 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TIMM44-208	ENST00000598968	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TIMM44-208	ENST00000598968	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TIMM44-208	ENST00000598968	POGK	Q9P215	609 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TIMM44-208	ENST00000598968	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.55	■■■□□ 2.8

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