RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589851.1

PTPRS-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 1,270 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-207ENST00000589851 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRS-207ENST00000589851 KIF1BO60333 1816 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRS-207ENST00000589851 FOXD1Q16676 465 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRS-207ENST00000589851 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
PTPRS-207ENST00000589851 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRS-207ENST00000589851 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRS-207ENST00000589851 CPS1P31327 1500 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRS-207ENST00000589851 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRS-207ENST00000589851 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRS-207ENST00000589851 FBXO41Q8TF61 875 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRS-207ENST00000589851 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRS-207ENST00000589851 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 BCANQ96GW7 911 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 TBX22Q9Y458 520 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRS-207ENST00000589851 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 DIP2AQ14689 1571 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 KCNA6P17658 529 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 PPLO60437 1756 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 NWD1Q149M9 1564 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRS-207ENST00000589851 PIK3R4Q99570 1358 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRS-207ENST00000589851 RGL3Q3MIN7 710 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRS-207ENST00000589851 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRS-207ENST00000589851 IFT172Q9UG01 1749 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRS-207ENST00000589851 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRS-207ENST00000589851 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 METP08581 1390 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 TMEM94Q12767 1356 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 PTPRUQ92729 1446 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 ALKQ9UM73 1620 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 TOM1O60784 492 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRS-207ENST00000589851 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRS-207ENST00000589851 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRS-207ENST00000589851 MYOM2P54296 1465 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRS-207ENST00000589851 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRS-207ENST00000589851 PIK3C2GO75747 1445 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRS-207ENST00000589851 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRS-207ENST00000589851 STAC3Q96MF2 364 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 MSH6P52701 1360 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 PIP4K2BP78356 416 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRS-207ENST00000589851 LAMC1P11047 1609 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 C14orf37Q86TY3 774 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 PTCH1Q13635 1447 aa23■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 ABCC11Q96J66 1382 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 TECPR2O15040 1411 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRS-207ENST00000589851 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 DCCP43146 1447 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 SLAIN2Q9P270 581 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 ATF3P18847 181 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 STK26Q9P289 416 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 HSPA1LP34931 641 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 NEUROD1Q13562 356 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 ADGRB1O14514 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRS-207ENST00000589851 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRS-207ENST00000589851 SIRT1Q96EB6 747 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRS-207ENST00000589851 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRS-207ENST00000589851 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRS-207ENST00000589851 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRS-207ENST00000589851 DLC1Q96QB1 1528 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRS-207ENST00000589851 MST1RQ04912 1400 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRS-207ENST00000589851 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRS-207ENST00000589851 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRS-207ENST00000589851 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.79■■□□□ 1.24
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