RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
GIPC1-211ENST00000589631 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.37■■■□□ 2.45
GIPC1-211ENST00000589631 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.36■■■□□ 2.45
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM52Q96A61 297 aa30.35■■■□□ 2.45
GIPC1-211ENST00000589631 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
GIPC1-211ENST00000589631 KCNA6P17658 529 aa30.33■■■□□ 2.45
GIPC1-211ENST00000589631 BCANQ96GW7 911 aa30.33■■■□□ 2.45
GIPC1-211ENST00000589631 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
GIPC1-211ENST00000589631 TRPM2O94759 1503 aa30.27■■■□□ 2.44
GIPC1-211ENST00000589631 TBX22Q9Y458 520 aa30.27■■■□□ 2.44
GIPC1-211ENST00000589631 ALKQ9UM73 1620 aa30.26■■■□□ 2.44
GIPC1-211ENST00000589631 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 PIP4K2BP78356 416 aa30.25■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 NWD1Q149M9 1564 aa30.24■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 CLTCL1P53675 1640 aa30.23■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 KIF1BO60333 1816 aa30.21■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
GIPC1-211ENST00000589631 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.2■■■□□ 2.42
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM94Q12767 1356 aa30.19■■■□□ 2.42
GIPC1-211ENST00000589631 DIP2AQ14689 1571 aa30.19■■■□□ 2.42
GIPC1-211ENST00000589631 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
GIPC1-211ENST00000589631 PIK3R4Q99570 1358 aa30.15■■■□□ 2.42
GIPC1-211ENST00000589631 HSPA1LP34931 641 aa30.14■■■□□ 2.42
GIPC1-211ENST00000589631 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.12■■■□□ 2.41
GIPC1-211ENST00000589631 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.11■■■□□ 2.41
GIPC1-211ENST00000589631 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.1■■■□□ 2.41
GIPC1-211ENST00000589631 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.1■■■□□ 2.41
GIPC1-211ENST00000589631 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-211ENST00000589631 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-211ENST00000589631 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.06■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 FOXD1Q16676 465 aa30.06■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 MSH6P52701 1360 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-211ENST00000589631 PTPRUQ92729 1446 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-211ENST00000589631 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-211ENST00000589631 PPLO60437 1756 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-211ENST00000589631 METP08581 1390 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-211ENST00000589631 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 SLAIN2Q9P270 581 aa29.93■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 C14orf37Q86TY3 774 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.91■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 HRCP23327 699 aa29.9■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
GIPC1-211ENST00000589631 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-211ENST00000589631 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
GIPC1-211ENST00000589631 RGL3Q3MIN7 710 aa29.86■■■□□ 2.37
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GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.84■■■□□ 2.37
GIPC1-211ENST00000589631 IFT172Q9UG01 1749 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-211ENST00000589631 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-211ENST00000589631 DCCP43146 1447 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-211ENST00000589631 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-211ENST00000589631 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-211ENST00000589631 ILDR2Q71H61 639 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-211ENST00000589631 PTCH1Q13635 1447 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-211ENST00000589631 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-211ENST00000589631 PHLPP1O60346 1717 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-211ENST00000589631 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.71■■■□□ 2.35
GIPC1-211ENST00000589631 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.7■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 PIK3C2GO75747 1445 aa29.7■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 MST1RQ04912 1400 aa29.68■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 BRINP3Q76B58 766 aa29.66■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 MYOM2P54296 1465 aa29.65■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.64■■■□□ 2.34
GIPC1-211ENST00000589631 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 JCADQ9P266 1359 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 TECPR2O15040 1411 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 ABCC11Q96J66 1382 aa29.61■■■□□ 2.33
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GIPC1-211ENST00000589631 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 LAMC1P11047 1609 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 STK26Q9P289 416 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-211ENST00000589631 STAC3Q96MF2 364 aa29.56■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 SOCS7O14512 581 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 SIRT1Q96EB6 747 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
GIPC1-211ENST00000589631 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.5■■■□□ 2.31
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