RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 HSPA1LP34931 641 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.72□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 TOM1O60784 492 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-209ENST00000580646 BCANQ96GW7 911 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-209ENST00000580646 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.7□□□□□ -0.06
GGA3-209ENST00000580646 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.69□□□□□ -0.06
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GGA3-209ENST00000580646 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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GGA3-209ENST00000580646 TRIM52Q96A61 297 aa14.67□□□□□ -0.06
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GGA3-209ENST00000580646 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.66□□□□□ -0.06
GGA3-209ENST00000580646 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-209ENST00000580646 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.65□□□□□ -0.06
GGA3-209ENST00000580646 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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GGA3-209ENST00000580646 TBX22Q9Y458 520 aa14.63□□□□□ -0.07
GGA3-209ENST00000580646 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GGA3-209ENST00000580646 KIF1BO60333 1816 aa14.62□□□□□ -0.07
GGA3-209ENST00000580646 TMEM94Q12767 1356 aa14.6□□□□□ -0.07
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GGA3-209ENST00000580646 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.6□□□□□ -0.07
GGA3-209ENST00000580646 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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GGA3-209ENST00000580646 PIK3R4Q99570 1358 aa14.55□□□□□ -0.08
GGA3-209ENST00000580646 NWD1Q149M9 1564 aa14.55□□□□□ -0.08
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GGA3-209ENST00000580646 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GGA3-209ENST00000580646 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.52□□□□□ -0.08
GGA3-209ENST00000580646 MSH6P52701 1360 aa14.52□□□□□ -0.08
GGA3-209ENST00000580646 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.52□□□□□ -0.09
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GGA3-209ENST00000580646 LAMC1P11047 1609 aa14.36□□□□□ -0.11
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GGA3-209ENST00000580646 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.35□□□□□ -0.11
GGA3-209ENST00000580646 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.35□□□□□ -0.11
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GGA3-209ENST00000580646 JCADQ9P266 1359 aa14.33□□□□□ -0.12
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GGA3-209ENST00000580646 MST1RQ04912 1400 aa14.32□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.32□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.32□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 STK26Q9P289 416 aa14.32□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.32□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
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GGA3-209ENST00000580646 PHLPP1O60346 1717 aa14.29□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.29□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.29□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 ABCC11Q96J66 1382 aa14.29□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.28□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.27□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
GGA3-209ENST00000580646 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.27□□□□□ -0.12
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