RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573324.1

SALL3-204, Transcript of spalt like transcription factor 3, human

TSL 3

Gene SALL3, Length 838 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SALL3-204	ENST00000573324	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SALL3-204	ENST00000573324	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SALL3-204	ENST00000573324	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SALL3-204	ENST00000573324	TOM1	O60784	492 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SALL3-204	ENST00000573324	TRPM2	O94759	1503 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SALL3-204	ENST00000573324	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SALL3-204	ENST00000573324	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SALL3-204	ENST00000573324	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SALL3-204	ENST00000573324	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	KCNA6	P17658	529 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.15	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SALL3-204	ENST00000573324	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SALL3-204	ENST00000573324	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SALL3-204	ENST00000573324	HSPA1L	P34931	641 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SALL3-204	ENST00000573324	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SALL3-204	ENST00000573324	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SALL3-204	ENST00000573324	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	KIF1B	O60333	1816 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SALL3-204	ENST00000573324	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SALL3-204	ENST00000573324	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SALL3-204	ENST00000573324	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SALL3-204	ENST00000573324	FOXD1	Q16676	465 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SALL3-204	ENST00000573324	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
SALL3-204	ENST00000573324	MSH6	P52701	1360 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SALL3-204	ENST00000573324	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SALL3-204	ENST00000573324	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SALL3-204	ENST00000573324	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	MET	P08581	1390 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	PPL	O60437	1756 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SALL3-204	ENST00000573324	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SALL3-204	ENST00000573324	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SALL3-204	ENST00000573324	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SALL3-204	ENST00000573324	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SALL3-204	ENST00000573324	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SALL3-204	ENST00000573324	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SALL3-204	ENST00000573324	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SALL3-204	ENST00000573324	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SALL3-204	ENST00000573324	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SALL3-204	ENST00000573324	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SALL3-204	ENST00000573324	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SALL3-204	ENST00000573324	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SALL3-204	ENST00000573324	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SALL3-204	ENST00000573324	DCC	P43146	1447 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SALL3-204	ENST00000573324	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SALL3-204	ENST00000573324	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SALL3-204	ENST00000573324	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SALL3-204	ENST00000573324	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SALL3-204	ENST00000573324	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SALL3-204	ENST00000573324	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	ATF3	P18847	181 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	MST1R	Q04912	1400 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SALL3-204	ENST00000573324	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SALL3-204	ENST00000573324	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SALL3-204	ENST00000573324	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SALL3-204	ENST00000573324	MYOM2	P54296	1465 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	HRC	P23327	699 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	SOCS7	O14512	581 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	TECPR2	O15040	1411 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SALL3-204	ENST00000573324	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SALL3-204	ENST00000573324	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SALL3-204	ENST00000573324	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SALL3-204	ENST00000573324	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SALL3-204	ENST00000573324	LAMC1	P11047	1609 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SALL3-204	ENST00000573324	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SALL3-204	ENST00000573324	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SALL3-204	ENST00000573324	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SALL3-204	ENST00000573324	LRP6	O75581	1613 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SALL3-204	ENST00000573324	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SALL3-204	ENST00000573324	STK26	Q9P289	416 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SALL3-204	ENST00000573324	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SALL3-204	ENST00000573324	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SALL3-204	ENST00000573324	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.32	■■■□□ 2.76

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