RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.08■■■□□ 2.73
NME3-210ENST00000567271 HDGFP51858 240 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
NME3-210ENST00000567271 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP32.03■■■□□ 2.72
NME3-210ENST00000567271 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
NME3-210ENST00000567271 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
NME3-210ENST00000567271 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.97■■■□□ 2.71
NME3-210ENST00000567271 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
NME3-210ENST00000567271 KIF1BO60333 1816 aa31.96■■■□□ 2.71
NME3-210ENST00000567271 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.95■■■□□ 2.71
NME3-210ENST00000567271 BCANQ96GW7 911 aa31.94■■■□□ 2.7
NME3-210ENST00000567271 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.94■■■□□ 2.7
NME3-210ENST00000567271 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
NME3-210ENST00000567271 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
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NME3-210ENST00000567271 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.87■■■□□ 2.69
NME3-210ENST00000567271 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.86■■■□□ 2.69
NME3-210ENST00000567271 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.85■■■□□ 2.69
NME3-210ENST00000567271 TBX22Q9Y458 520 aa31.85■■■□□ 2.69
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NME3-210ENST00000567271 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.84■■■□□ 2.69
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NME3-210ENST00000567271 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.76■■■□□ 2.68
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NME3-210ENST00000567271 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.76■■■□□ 2.67
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NME3-210ENST00000567271 PIK3R4Q99570 1358 aa31.71■■■□□ 2.67
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NME3-210ENST00000567271 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.64■■■□□ 2.66
NME3-210ENST00000567271 METP08581 1390 aa31.64■■■□□ 2.66
NME3-210ENST00000567271 PTPRUQ92729 1446 aa31.63■■■□□ 2.65
NME3-210ENST00000567271 TMEM94Q12767 1356 aa31.62■■■□□ 2.65
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NME3-210ENST00000567271 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
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NME3-210ENST00000567271 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.5■■■□□ 2.63
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NME3-210ENST00000567271 STAC3Q96MF2 364 aa31.47■■■□□ 2.63
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NME3-210ENST00000567271 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.42■■■□□ 2.62
NME3-210ENST00000567271 C14orf37Q86TY3 774 aa31.42■■■□□ 2.62
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NME3-210ENST00000567271 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
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NME3-210ENST00000567271 PTCH1Q13635 1447 aa31.4■■■□□ 2.62
NME3-210ENST00000567271 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.39■■■□□ 2.62
NME3-210ENST00000567271 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.39■■■□□ 2.61
NME3-210ENST00000567271 ROBO2Q9HCK4 1378 aa31.38■■■□□ 2.61
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NME3-210ENST00000567271 ABCC11Q96J66 1382 aa31.33■■■□□ 2.61
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NME3-210ENST00000567271 TECPR2O15040 1411 aa31.32■■■□□ 2.6
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NME3-210ENST00000567271 SLAIN2Q9P270 581 aa31.31■■■□□ 2.6
NME3-210ENST00000567271 ATF3P18847 181 aa31.3■■■□□ 2.6
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NME3-210ENST00000567271 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.29■■■□□ 2.6
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NME3-210ENST00000567271 DCCP43146 1447 aa31.27■■■□□ 2.6
NME3-210ENST00000567271 HSPA1LP34931 641 aa31.26■■■□□ 2.59
NME3-210ENST00000567271 ADGRB1O14514 1584 aa31.26■■■□□ 2.59
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NME3-210ENST00000567271 SIRT1Q96EB6 747 aa31.25■■■□□ 2.59
NME3-210ENST00000567271 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.24■■■□□ 2.59
NME3-210ENST00000567271 NALCNQ8IZF0 1738 aa31.23■■■□□ 2.59
NME3-210ENST00000567271 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.19■■■□□ 2.58
NME3-210ENST00000567271 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.18■■■□□ 2.58
NME3-210ENST00000567271 DLC1Q96QB1 1528 aa31.16■■■□□ 2.58
NME3-210ENST00000567271 MST1RQ04912 1400 aa31.15■■■□□ 2.58
NME3-210ENST00000567271 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.15■■■□□ 2.58
NME3-210ENST00000567271 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.15■■■□□ 2.58
NME3-210ENST00000567271 PRAM1Q96QH2 718 aa31.14■■■□□ 2.58
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