RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.81□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 CHD1O14646 1710 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 CAMK2BQ13554 666 aa9.8□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.79□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 C3orf80F5H4A9 247 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.78□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 APLP1P51693 650 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 CFTRP13569 1480 aa9.77□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 PRSS12P56730 875 aa9.76□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 PNMA3Q9UL41 463 aa9.76□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 GGCXP38435 758 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 TATDN2Q93075 761 aa9.75□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 COPS2P61201 443 aa9.74□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 ARAP1Q96P48 1450 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF26B4DH59 902 aa9.73□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.71□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 POTECB2RU33 542 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 PKDCCQ504Y2 493 aa9.7□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 TOPBP1Q92547 1522 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 CERKQ8TCT0 537 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 PDIA6Q15084 440 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 SLC19A1P41440 591 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 IFT140Q96RY7 1462 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 ZPR1O75312 459 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-209ENST00000561136 DGAT1O75907 488 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 RNF223E7ERA6 249 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 NECTIN2Q92692 538 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 SLF2Q8IX21 1173 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 FAM187AA6NFU0 413 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 SPRYD7Q5W111 196 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 TREML4Q6UXN2 200 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-209ENST00000561136 PRR20EP86478 221 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PRR20CP86479 221 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PRR20DP86480 221 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PRR20BP86481 221 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PRR20AP86496 221 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 TNFRSF10AO00220 468 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 ST8SIA5O15466 376 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 TLL1O43897 1013 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 WDR97A6NE52 1622 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 SLC4A3P48751 1232 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 OSBPP22059 807 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PADI6Q6TGC4 694 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PBRM1Q86U86 1689 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 PRR14Q9BWN1 585 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-209ENST00000561136 GDF9O60383 454 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 S1PR4O95977 384 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 TTC13Q8NBP0 860 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 AAASQ9NRG9 546 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 EYA1Q99502 592 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 SYNJ1O43426 1573 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 CUX1P39880 1505 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 E2F4Q16254 413 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-209ENST00000561136 ARXQ96QS3 562 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 WFS1O76024 890 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 FOXC1Q12948 553 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 DACH1Q9UI36 760 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC8Q09428 1581 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD3-209ENST00000561136 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms