RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554894.5

LINC01578-204, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01578, Length 556 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01578-204ENST00000554894 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.55■■■■■ 4.4
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LINC01578-204ENST00000554894 TRPM2O94759 1503 aa42.54■■■■■ 4.4
LINC01578-204ENST00000554894 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
LINC01578-204ENST00000554894 BCANQ96GW7 911 aa42.53■■■■■ 4.4
LINC01578-204ENST00000554894 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
LINC01578-204ENST00000554894 CLTCL1P53675 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
LINC01578-204ENST00000554894 ALKQ9UM73 1620 aa42.51■■■■■ 4.4
LINC01578-204ENST00000554894 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
LINC01578-204ENST00000554894 TOM1O60784 492 aa42.5■■■■■ 4.39
LINC01578-204ENST00000554894 NWD1Q149M9 1564 aa42.48■■■■■ 4.39
LINC01578-204ENST00000554894 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.48■■■■■ 4.39
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LINC01578-204ENST00000554894 PIP4K2BP78356 416 aa42.45■■■■■ 4.39
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LINC01578-204ENST00000554894 KIF1BO60333 1816 aa42.41■■■■■ 4.38
LINC01578-204ENST00000554894 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
LINC01578-204ENST00000554894 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
LINC01578-204ENST00000554894 DIP2AQ14689 1571 aa42.38■■■■■ 4.37
LINC01578-204ENST00000554894 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.37■■■■■ 4.37
LINC01578-204ENST00000554894 TMEM94Q12767 1356 aa42.33■■■■■ 4.37
LINC01578-204ENST00000554894 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
LINC01578-204ENST00000554894 TBX22Q9Y458 520 aa42.31■■■■■ 4.36
LINC01578-204ENST00000554894 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.3■■■■■ 4.36
LINC01578-204ENST00000554894 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.29■■■■■ 4.36
LINC01578-204ENST00000554894 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
LINC01578-204ENST00000554894 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.26■■■■■ 4.36
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LINC01578-204ENST00000554894 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.24■■■■■ 4.35
LINC01578-204ENST00000554894 HSPA1LP34931 641 aa42.24■■■■■ 4.35
LINC01578-204ENST00000554894 FOXD1Q16676 465 aa42.23■■■■■ 4.35
LINC01578-204ENST00000554894 PIK3R4Q99570 1358 aa42.19■■■■■ 4.34
LINC01578-204ENST00000554894 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.16■■■■■ 4.34
LINC01578-204ENST00000554894 PTPRUQ92729 1446 aa42.12■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.11■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.11■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 PPLO60437 1756 aa42.1■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 MSH6P52701 1360 aa42.1■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.09■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
LINC01578-204ENST00000554894 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa42.04■■■■■ 4.32
LINC01578-204ENST00000554894 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa42.03■■■■■ 4.32
LINC01578-204ENST00000554894 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa42.03■■■■■ 4.32
LINC01578-204ENST00000554894 METP08581 1390 aa42.02■■■■■ 4.32
LINC01578-204ENST00000554894 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
LINC01578-204ENST00000554894 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42■■■■■ 4.31
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LINC01578-204ENST00000554894 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
LINC01578-204ENST00000554894 IFT172Q9UG01 1749 aa41.95■■■■■ 4.31
LINC01578-204ENST00000554894 C14orf37Q86TY3 774 aa41.95■■■■■ 4.31
LINC01578-204ENST00000554894 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.95■■■■■ 4.31
LINC01578-204ENST00000554894 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
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LINC01578-204ENST00000554894 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.84■■■■■ 4.29
LINC01578-204ENST00000554894 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.79■■■■■ 4.28
LINC01578-204ENST00000554894 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.79■■■■■ 4.28
LINC01578-204ENST00000554894 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.79■■■■■ 4.28
LINC01578-204ENST00000554894 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.78■■■■■ 4.28
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LINC01578-204ENST00000554894 PHLPP1O60346 1717 aa41.78■■■■■ 4.28
LINC01578-204ENST00000554894 DCCP43146 1447 aa41.78■■■■■ 4.28
LINC01578-204ENST00000554894 PTCH1Q13635 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
LINC01578-204ENST00000554894 ILDR2Q71H61 639 aa41.75■■■■■ 4.27
LINC01578-204ENST00000554894 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.73■■■■■ 4.27
LINC01578-204ENST00000554894 HRCP23327 699 aa41.72■■■■■ 4.27
LINC01578-204ENST00000554894 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.71■■■■■ 4.27
LINC01578-204ENST00000554894 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.69■■■■■ 4.26
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LINC01578-204ENST00000554894 TECPR2O15040 1411 aa41.52■■■■■ 4.24
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LINC01578-204ENST00000554894 JCADQ9P266 1359 aa41.5■■■■■ 4.23
LINC01578-204ENST00000554894 STK26Q9P289 416 aa41.49■■■■■ 4.23
LINC01578-204ENST00000554894 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
LINC01578-204ENST00000554894 C1orf167Q5SNV9 1468 aa41.45■■■■■ 4.23
LINC01578-204ENST00000554894 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
LINC01578-204ENST00000554894 ABCC11Q96J66 1382 aa41.44■■■■■ 4.22
LINC01578-204ENST00000554894 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.44■■■■■ 4.22
LINC01578-204ENST00000554894 SHPRHQ149N8 1683 aa41.42■■■■■ 4.22
LINC01578-204ENST00000554894 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.42■■■■■ 4.22
LINC01578-204ENST00000554894 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.39■■■■■ 4.22
LINC01578-204ENST00000554894 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.37■■■■■ 4.21
LINC01578-204ENST00000554894 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.34■■■■■ 4.21
LINC01578-204ENST00000554894 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
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