RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.64■■□□□ 1.85
CS-219ENST00000550655 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-219ENST00000550655 NWD1Q149M9 1564 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-219ENST00000550655 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CS-219ENST00000550655 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.59■■□□□ 1.85
CS-219ENST00000550655 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CS-219ENST00000550655 ALKQ9UM73 1620 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-219ENST00000550655 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 DIP2AQ14689 1571 aa26.57■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.54■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.53■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CS-219ENST00000550655 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.51■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.5■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 KCNA6P17658 529 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 FOXD1Q16676 465 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 BCANQ96GW7 911 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 PPLO60437 1756 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.47■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
CS-219ENST00000550655 TBX22Q9Y458 520 aa26.45■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 IFT172Q9UG01 1749 aa26.42■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 TMEM94Q12767 1356 aa26.42■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 TOM1O60784 492 aa26.41■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 PIK3R4Q99570 1358 aa26.41■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.4■■□□□ 1.82
CS-219ENST00000550655 PTPRUQ92729 1446 aa26.38■■□□□ 1.81
CS-219ENST00000550655 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-219ENST00000550655 PIP4K2BP78356 416 aa26.35■■□□□ 1.81
CS-219ENST00000550655 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CS-219ENST00000550655 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CS-219ENST00000550655 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CS-219ENST00000550655 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-219ENST00000550655 METP08581 1390 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-219ENST00000550655 HRCP23327 699 aa26.29■■□□□ 1.8
CS-219ENST00000550655 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.28■■□□□ 1.8
CS-219ENST00000550655 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CS-219ENST00000550655 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CS-219ENST00000550655 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.25■■□□□ 1.79
CS-219ENST00000550655 MSH6P52701 1360 aa26.25■■□□□ 1.79
CS-219ENST00000550655 HSPA1LP34931 641 aa26.25■■□□□ 1.79
CS-219ENST00000550655 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.25■■□□□ 1.79
CS-219ENST00000550655 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.22■■□□□ 1.79
CS-219ENST00000550655 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.21■■□□□ 1.79
CS-219ENST00000550655 RGL3Q3MIN7 710 aa26.2■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.2■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.2■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.19■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.18■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 PIK3C2GO75747 1445 aa26.17■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 PTCH1Q13635 1447 aa26.17■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 MYOM2P54296 1465 aa26.17■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.16■■□□□ 1.78
CS-219ENST00000550655 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.14■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 LAMC1P11047 1609 aa26.14■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 DCCP43146 1447 aa26.14■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.12■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 C14orf37Q86TY3 774 aa26.11■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.11■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.1■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 PHLPP1O60346 1717 aa26.09■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 SLAIN2Q9P270 581 aa26.09■■□□□ 1.77
CS-219ENST00000550655 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.07■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 TECPR2O15040 1411 aa26.05■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 MST1RQ04912 1400 aa26.05■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 ATF3P18847 181 aa26.04■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.04■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CS-219ENST00000550655 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.99■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.99■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 ABCC11Q96J66 1382 aa25.97■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.97■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 ADGRB1O14514 1584 aa25.97■■□□□ 1.75
CS-219ENST00000550655 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.95■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 BRINP3Q76B58 766 aa25.94■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 STK26Q9P289 416 aa25.93■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.92■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.91■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.91■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 SHPRHQ149N8 1683 aa25.9■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 DLC1Q96QB1 1528 aa25.9■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.89■■□□□ 1.74
CS-219ENST00000550655 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.88■■□□□ 1.73
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