RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529048.5

TSTA3-209, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-209ENST00000529048 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.71■□□□□ 0.91
TSTA3-209ENST00000529048 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.71■□□□□ 0.91
TSTA3-209ENST00000529048 TRPM2O94759 1503 aa20.7■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 BCANQ96GW7 911 aa20.7■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 FBXO41Q8TF61 875 aa20.69■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.69■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 ZFYVE9O95405 1425 aa20.69■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.68■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 KIF1BO60333 1816 aa20.68■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
TSTA3-209ENST00000529048 CPS1P31327 1500 aa20.61■□□□□ 0.89
TSTA3-209ENST00000529048 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-209ENST00000529048 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSTA3-209ENST00000529048 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
TSTA3-209ENST00000529048 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.57■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.56■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.55■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.54■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.54■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 RGL3Q3MIN7 710 aa20.53■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.53■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TSTA3-209ENST00000529048 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 PPLO60437 1756 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 KCNA6P17658 529 aa20.51■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 HRCP23327 699 aa20.5■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 TBX22Q9Y458 520 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 NWD1Q149M9 1564 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 DIP2AQ14689 1571 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 PIP4K2BP78356 416 aa20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 TMEM94Q12767 1356 aa20.46■□□□□ 0.87
TSTA3-209ENST00000529048 PTPRUQ92729 1446 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 IFT172Q9UG01 1749 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 ALKQ9UM73 1620 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 METP08581 1390 aa20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.42■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 TOM1O60784 492 aa20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-209ENST00000529048 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TSTA3-209ENST00000529048 PIK3R4Q99570 1358 aa20.37■□□□□ 0.85
TSTA3-209ENST00000529048 C14orf37Q86TY3 774 aa20.36■□□□□ 0.85
TSTA3-209ENST00000529048 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.32■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 MSH6P52701 1360 aa20.32■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 HSPA1LP34931 641 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 PIK3C2GO75747 1445 aa20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 STK26Q9P289 416 aa20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 MYOM2P54296 1465 aa20.27■□□□□ 0.84
TSTA3-209ENST00000529048 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.26■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.26■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.25■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.25■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.25■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.24■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.23■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.23■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 ATF3P18847 181 aa20.22■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 SLAIN2Q9P270 581 aa20.22■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 NEUROD1Q13562 356 aa20.21■□□□□ 0.83
TSTA3-209ENST00000529048 PTCH1Q13635 1447 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 LAMC1P11047 1609 aa20.2■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.18■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.18■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.18■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.18■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.15■□□□□ 0.82
TSTA3-209ENST00000529048 ABCC11Q96J66 1382 aa20.14■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 PHLPP1O60346 1717 aa20.13■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 TECPR2O15040 1411 aa20.13■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 DCCP43146 1447 aa20.13■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 MST1RQ04912 1400 aa20.13■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 ADGRB1O14514 1584 aa20.12■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.12■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.11■□□□□ 0.81
TSTA3-209ENST00000529048 BRINP3Q76B58 766 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms