RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518564.1

PPP2CB-204, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PPP2CB, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-204ENST00000518564 BCANQ96GW7 911 aa47.33■■■■■ 5.17
PPP2CB-204ENST00000518564 LRRC7Q96NW7 1537 aa47.31■■■■■ 5.16
PPP2CB-204ENST00000518564 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa47.29■■■■■ 5.16
PPP2CB-204ENST00000518564 TRPM2O94759 1503 aa47.29■■■■■ 5.16
PPP2CB-204ENST00000518564 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP47.28■■■■■ 5.16
PPP2CB-204ENST00000518564 SLC26A8Q96RN1 970 aa47.27■■■■■ 5.16
PPP2CB-204ENST00000518564 TOM1O60784 492 aa47.23■■■■■ 5.15
PPP2CB-204ENST00000518564 CLTCL1P53675 1640 aa47.23■■■■■ 5.15
PPP2CB-204ENST00000518564 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
PPP2CB-204ENST00000518564 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP47.18■■■■■ 5.14
PPP2CB-204ENST00000518564 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
PPP2CB-204ENST00000518564 NWD1Q149M9 1564 aa47.15■■■■■ 5.14
PPP2CB-204ENST00000518564 KIF1BO60333 1816 aa47.14■■■■■ 5.14
PPP2CB-204ENST00000518564 KCNA6P17658 529 aa47.14■■■■■ 5.14
PPP2CB-204ENST00000518564 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
PPP2CB-204ENST00000518564 DIP2AQ14689 1571 aa47.11■■■■■ 5.13
PPP2CB-204ENST00000518564 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
PPP2CB-204ENST00000518564 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
PPP2CB-204ENST00000518564 PIP4K2BP78356 416 aa47.1■■■■■ 5.13
PPP2CB-204ENST00000518564 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
PPP2CB-204ENST00000518564 ALKQ9UM73 1620 aa47.05■■■■■ 5.12
PPP2CB-204ENST00000518564 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
PPP2CB-204ENST00000518564 TBX22Q9Y458 520 aa47.02■■■■■ 5.12
PPP2CB-204ENST00000518564 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa47.02■■■■■ 5.12
PPP2CB-204ENST00000518564 SETD5Q9C0A6 1442 aa47.02■■■■■ 5.12
PPP2CB-204ENST00000518564 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
PPP2CB-204ENST00000518564 TMEM94Q12767 1356 aa47■■■■■ 5.12
PPP2CB-204ENST00000518564 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP46.98■■■■■ 5.11
PPP2CB-204ENST00000518564 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa46.97■■■■■ 5.11
PPP2CB-204ENST00000518564 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa46.94■■■■■ 5.1
PPP2CB-204ENST00000518564 MPHOSPH9Q99550 1183 aa46.92■■■■■ 5.1
PPP2CB-204ENST00000518564 PIK3R4Q99570 1358 aa46.92■■■■■ 5.1
PPP2CB-204ENST00000518564 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa46.91■■■■■ 5.1
PPP2CB-204ENST00000518564 FOXD1Q16676 465 aa46.91■■■■■ 5.1
PPP2CB-204ENST00000518564 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.86■■■■■ 5.09
PPP2CB-204ENST00000518564 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.86■■■■■ 5.09
PPP2CB-204ENST00000518564 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
PPP2CB-204ENST00000518564 HSPA1LP34931 641 aa46.83■■■■■ 5.09
PPP2CB-204ENST00000518564 MSH6P52701 1360 aa46.8■■■■■ 5.08
PPP2CB-204ENST00000518564 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa46.76■■■■■ 5.08
PPP2CB-204ENST00000518564 PPLO60437 1756 aa46.75■■■■■ 5.08
PPP2CB-204ENST00000518564 VGFO15240 615 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
PPP2CB-204ENST00000518564 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
PPP2CB-204ENST00000518564 PTPRUQ92729 1446 aa46.71■■■■■ 5.07
PPP2CB-204ENST00000518564 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa46.71■■■■■ 5.07
PPP2CB-204ENST00000518564 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa46.71■■■■■ 5.07
PPP2CB-204ENST00000518564 C14orf37Q86TY3 774 aa46.69■■■■■ 5.06
PPP2CB-204ENST00000518564 DISP3Q9P2K9 1392 aa46.68■■■■■ 5.06
PPP2CB-204ENST00000518564 METP08581 1390 aa46.65■■■■■ 5.06
PPP2CB-204ENST00000518564 FAM135BQ49AJ0 1406 aa46.62■■■■■ 5.05
PPP2CB-204ENST00000518564 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46.62■■■■■ 5.05
PPP2CB-204ENST00000518564 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa46.62■■■■■ 5.05
PPP2CB-204ENST00000518564 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
PPP2CB-204ENST00000518564 IFT172Q9UG01 1749 aa46.57■■■■■ 5.05
PPP2CB-204ENST00000518564 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.04
PPP2CB-204ENST00000518564 RGL3Q3MIN7 710 aa46.56■■■■■ 5.04
PPP2CB-204ENST00000518564 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa46.51■■■■■ 5.04
PPP2CB-204ENST00000518564 C19orf44Q9H6X5 657 aa46.51■■■■■ 5.04
PPP2CB-204ENST00000518564 SLAIN2Q9P270 581 aa46.5■■■■■ 5.03
PPP2CB-204ENST00000518564 HRCP23327 699 aa46.49■■■■■ 5.03
PPP2CB-204ENST00000518564 ATF3P18847 181 aa46.48■■■■■ 5.03
PPP2CB-204ENST00000518564 CADPS2Q86UW7 1296 aa46.48■■■■■ 5.03
PPP2CB-204ENST00000518564 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
PPP2CB-204ENST00000518564 DCCP43146 1447 aa46.44■■■■■ 5.02
PPP2CB-204ENST00000518564 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa46.42■■■■■ 5.02
PPP2CB-204ENST00000518564 PTCH1Q13635 1447 aa46.42■■■■■ 5.02
PPP2CB-204ENST00000518564 NALCNQ8IZF0 1738 aa46.37■■■■■ 5.01
PPP2CB-204ENST00000518564 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa46.37■■■■■ 5.01
PPP2CB-204ENST00000518564 PRAG1Q86YV5 1406 aa46.35■■■■■ 5.01
PPP2CB-204ENST00000518564 PHLPP1O60346 1717 aa46.34■■■■■ 5.01
PPP2CB-204ENST00000518564 PIK3C2GO75747 1445 aa46.34■■■■■ 5.01
PPP2CB-204ENST00000518564 ROBO2Q9HCK4 1378 aa46.29■■■■■ 5
PPP2CB-204ENST00000518564 MYOM2P54296 1465 aa46.29■■■■■ 5
PPP2CB-204ENST00000518564 LAMC1P11047 1609 aa46.23■■■■■ 4.99
PPP2CB-204ENST00000518564 MST1RQ04912 1400 aa46.22■■■■■ 4.99
PPP2CB-204ENST00000518564 NRXN1Q9ULB1 1477 aa46.21■■■■■ 4.99
PPP2CB-204ENST00000518564 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa46.2■■■■■ 4.99
PPP2CB-204ENST00000518564 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
PPP2CB-204ENST00000518564 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP46.18■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 KNDC1Q76NI1 1749 aa46.18■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 TECPR2O15040 1411 aa46.14■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 ILDR2Q71H61 639 aa46.14■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 BRINP3Q76B58 766 aa46.14■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 STK26Q9P289 416 aa46.13■■■■■ 4.98
PPP2CB-204ENST00000518564 TMEM132EQ6IEE7 984 aa46.11■■■■■ 4.97
PPP2CB-204ENST00000518564 JCADQ9P266 1359 aa46.09■■■■■ 4.97
PPP2CB-204ENST00000518564 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
PPP2CB-204ENST00000518564 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
PPP2CB-204ENST00000518564 ABCC11Q96J66 1382 aa46.08■■■■■ 4.97
PPP2CB-204ENST00000518564 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa46.05■■■■■ 4.96
PPP2CB-204ENST00000518564 NHSL1Q5SYE7 1610 aa46.04■■■■■ 4.96
PPP2CB-204ENST00000518564 C1orf167Q5SNV9 1468 aa46.03■■■■■ 4.96
PPP2CB-204ENST00000518564 CFAP70Q5T0N1 1121 aa46.02■■■■■ 4.96
PPP2CB-204ENST00000518564 DCAF11Q8TEB1 546 aa46.01■■■■■ 4.96
PPP2CB-204ENST00000518564 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
PPP2CB-204ENST00000518564 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa45.97■■■■■ 4.95
PPP2CB-204ENST00000518564 SHPRHQ149N8 1683 aa45.96■■■■■ 4.95
PPP2CB-204ENST00000518564 WAPLQ7Z5K2 1190 aa45.96■■■■■ 4.95
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