RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 CLTCL1P53675 1640 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-225ENST00000513069 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-225ENST00000513069 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-225ENST00000513069 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-225ENST00000513069 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-225ENST00000513069 FBXO41Q8TF61 875 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-225ENST00000513069 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 CPS1P31327 1500 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 BCANQ96GW7 911 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 TBX22Q9Y458 520 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-225ENST00000513069 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF1BO60333 1816 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNA6P17658 529 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 RGL3Q3MIN7 710 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-225ENST00000513069 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 NWD1Q149M9 1564 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPRUQ92729 1446 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 METP08581 1390 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 PIK3R4Q99570 1358 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 DIP2AQ14689 1571 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM94Q12767 1356 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-225ENST00000513069 PPLO60437 1756 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-225ENST00000513069 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-225ENST00000513069 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ALKQ9UM73 1620 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-225ENST00000513069 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TOM1O60784 492 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 IFT172Q9UG01 1749 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PIK3C2GO75747 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PIP4K2BP78356 416 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-225ENST00000513069 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 MYOM2P54296 1465 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 MSH6P52701 1360 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-225ENST00000513069 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 STAC3Q96MF2 364 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 PTCH1Q13635 1447 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 C14orf37Q86TY3 774 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 HSPA1LP34931 641 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 SLAIN2Q9P270 581 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 STK26Q9P289 416 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCC11Q96J66 1382 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 TECPR2O15040 1411 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-225ENST00000513069 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 NEUROD1Q13562 356 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ATF3P18847 181 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 DCCP43146 1447 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 ADGRB1O14514 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 SIRT1Q96EB6 747 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-225ENST00000513069 LAMC1P11047 1609 aa22.02■■□□□ 1.11
SH3BP2-225ENST00000513069 NALCNQ8IZF0 1738 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-225ENST00000513069 MST1RQ04912 1400 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-225ENST00000513069 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-225ENST00000513069 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-225ENST00000513069 BRINP3Q76B58 766 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-225ENST00000513069 PRAM1Q96QH2 718 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-225ENST00000513069 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.95■■□□□ 1.1
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