RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 NWD1Q149M9 1564 aa28.14■■■□□ 2.1
SH3BP2-218ENST00000511185 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.14■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 ALKQ9UM73 1620 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2-218ENST00000511185 PPLO60437 1756 aa28.06■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 DIP2AQ14689 1571 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXD1Q16676 465 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT172Q9UG01 1749 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2-218ENST00000511185 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2-218ENST00000511185 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
SH3BP2-218ENST00000511185 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP2-218ENST00000511185 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
SH3BP2-218ENST00000511185 BCANQ96GW7 911 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BP2-218ENST00000511185 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.89■■■□□ 2.06
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM94Q12767 1356 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRUQ92729 1446 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNA6P17658 529 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2-218ENST00000511185 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PIP4K2BP78356 416 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TBX22Q9Y458 520 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3R4Q99570 1358 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 METP08581 1390 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TOM1O60784 492 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA1LP34931 641 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 RGL3Q3MIN7 710 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 MSH6P52701 1360 aa27.68■■■□□ 2.02
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SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3C2GO75747 1445 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOM2P54296 1465 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMC1P11047 1609 aa27.64■■■□□ 2.02
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SH3BP2-218ENST00000511185 HRCP23327 699 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-218ENST00000511185 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PHLPP1O60346 1717 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP2-218ENST00000511185 PTCH1Q13635 1447 aa27.61■■■□□ 2.01
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SH3BP2-218ENST00000511185 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.57■■■□□ 2
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.57■■■□□ 2
SH3BP2-218ENST00000511185 C14orf37Q86TY3 774 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP2-218ENST00000511185 DCCP43146 1447 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP2-218ENST00000511185 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
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SH3BP2-218ENST00000511185 TECPR2O15040 1411 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-218ENST00000511185 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-218ENST00000511185 SLAIN2Q9P270 581 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRB1O14514 1584 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-218ENST00000511185 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 ATF3P18847 181 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.41■■□□□ 1.98
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SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 STK26Q9P289 416 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-218ENST00000511185 SHPRHQ149N8 1683 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC11Q96J66 1382 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 BRINP3Q76B58 766 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.35■■□□□ 1.97
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