RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.33■■■□□ 2.61
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
SH3BP2-210ENST00000505941 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP2-210ENST00000505941 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.29■■■□□ 2.6
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.28■■■□□ 2.6
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFYVE9O95405 1425 aa31.26■■■□□ 2.6
SH3BP2-210ENST00000505941 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.25■■■□□ 2.59
SH3BP2-210ENST00000505941 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
SH3BP2-210ENST00000505941 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
SH3BP2-210ENST00000505941 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.25■■■□□ 2.59
SH3BP2-210ENST00000505941 TRPM2O94759 1503 aa31.24■■■□□ 2.59
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.21■■■□□ 2.59
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SH3BP2-210ENST00000505941 TOM1O60784 492 aa31.19■■■□□ 2.58
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNA6P17658 529 aa31.19■■■□□ 2.58
SH3BP2-210ENST00000505941 CLTCL1P53675 1640 aa31.17■■■□□ 2.58
SH3BP2-210ENST00000505941 TBX22Q9Y458 520 aa31.17■■■□□ 2.58
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF1BO60333 1816 aa31.17■■■□□ 2.58
SH3BP2-210ENST00000505941 HRCP23327 699 aa31.14■■■□□ 2.58
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.12■■■□□ 2.57
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SH3BP2-210ENST00000505941 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.09■■■□□ 2.57
SH3BP2-210ENST00000505941 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
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SH3BP2-210ENST00000505941 PIK3R4Q99570 1358 aa31.03■■■□□ 2.56
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.01■■■□□ 2.55
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SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM94Q12767 1356 aa31■■■□□ 2.55
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SH3BP2-210ENST00000505941 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BP2-210ENST00000505941 C14orf37Q86TY3 774 aa30.95■■■□□ 2.55
SH3BP2-210ENST00000505941 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.95■■■□□ 2.54
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
SH3BP2-210ENST00000505941 MSH6P52701 1360 aa30.91■■■□□ 2.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.89■■■□□ 2.54
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.88■■■□□ 2.53
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SH3BP2-210ENST00000505941 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BP2-210ENST00000505941 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BP2-210ENST00000505941 PPLO60437 1756 aa30.85■■■□□ 2.53
SH3BP2-210ENST00000505941 METP08581 1390 aa30.85■■■□□ 2.53
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRUQ92729 1446 aa30.82■■■□□ 2.52
SH3BP2-210ENST00000505941 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.81■■■□□ 2.52
SH3BP2-210ENST00000505941 HSPA1LP34931 641 aa30.8■■■□□ 2.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ATF3P18847 181 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BP2-210ENST00000505941 ALKQ9UM73 1620 aa30.77■■■□□ 2.52
SH3BP2-210ENST00000505941 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.76■■■□□ 2.51
SH3BP2-210ENST00000505941 SLAIN2Q9P270 581 aa30.76■■■□□ 2.51
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
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SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.67■■■□□ 2.5
SH3BP2-210ENST00000505941 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.66■■■□□ 2.5
SH3BP2-210ENST00000505941 PIK3C2GO75747 1445 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BP2-210ENST00000505941 STK26Q9P289 416 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BP2-210ENST00000505941 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
SH3BP2-210ENST00000505941 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
SH3BP2-210ENST00000505941 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
SH3BP2-210ENST00000505941 MYOM2P54296 1465 aa30.63■■■□□ 2.49
SH3BP2-210ENST00000505941 PTCH1Q13635 1447 aa30.63■■■□□ 2.49
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.62■■■□□ 2.49
SH3BP2-210ENST00000505941 DCCP43146 1447 aa30.61■■■□□ 2.49
SH3BP2-210ENST00000505941 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.6■■■□□ 2.49
SH3BP2-210ENST00000505941 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.59■■■□□ 2.49
SH3BP2-210ENST00000505941 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.58■■■□□ 2.49
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SH3BP2-210ENST00000505941 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.56■■■□□ 2.48
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.56■■■□□ 2.48
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCC11Q96J66 1382 aa30.55■■■□□ 2.48
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SH3BP2-210ENST00000505941 SIRT1Q96EB6 747 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BP2-210ENST00000505941 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.49■■■□□ 2.47
SH3BP2-210ENST00000505941 TECPR2O15040 1411 aa30.48■■■□□ 2.47
SH3BP2-210ENST00000505941 BRINP3Q76B58 766 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP2-210ENST00000505941 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP2-210ENST00000505941 MST1RQ04912 1400 aa30.46■■■□□ 2.47
SH3BP2-210ENST00000505941 NEUROD1Q13562 356 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 POGKQ9P215 609 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.43■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PHLPP1O60346 1717 aa30.43■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.42■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.41■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.39■■■□□ 2.46
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAM1Q96QH2 718 aa30.38■■■□□ 2.45
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.38■■■□□ 2.45
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