RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PTPRVP-202ENST00000490575 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRVP-202ENST00000490575 EID1Q9Y6B2 187 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF1BO60333 1816 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRVP-202ENST00000490575 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRVP-202ENST00000490575 FBXO41Q8TF61 875 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRVP-202ENST00000490575 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRVP-202ENST00000490575 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 CPS1P31327 1500 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 HRCP23327 699 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRVP-202ENST00000490575 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 BCANQ96GW7 911 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 PPLO60437 1756 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 NWD1Q149M9 1564 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 ALKQ9UM73 1620 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 TBX22Q9Y458 520 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 IFT172Q9UG01 1749 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNA6P17658 529 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 RGL3Q3MIN7 710 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPRUQ92729 1446 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRVP-202ENST00000490575 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRVP-202ENST00000490575 DIP2AQ14689 1571 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRVP-202ENST00000490575 METP08581 1390 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRVP-202ENST00000490575 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRVP-202ENST00000490575 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM94Q12767 1356 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRVP-202ENST00000490575 PIK3R4Q99570 1358 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 PIP4K2BP78356 416 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 PIK3C2GO75747 1445 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRVP-202ENST00000490575 TOM1O60784 492 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 MYOM2P54296 1465 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRVP-202ENST00000490575 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 HSPA1LP34931 641 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 MSH6P52701 1360 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRVP-202ENST00000490575 PTCH1Q13635 1447 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 STK26Q9P289 416 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 C14orf37Q86TY3 774 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 ADGRB1O14514 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 LAMC1P11047 1609 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 SLAIN2Q9P270 581 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 TECPR2O15040 1411 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC11Q96J66 1382 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 NEUROD1Q13562 356 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 MST1RQ04912 1400 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 DCCP43146 1447 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 ATF3P18847 181 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRVP-202ENST00000490575 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 STAC3Q96MF2 364 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 BRINP3Q76B58 766 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRVP-202ENST00000490575 PHLPP1O60346 1717 aa23.59■■□□□ 1.37
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