RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 HRCP23327 699 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-210ENST00000488157 KIF1BO60333 1816 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-210ENST00000488157 CERKQ8TCT0 537 aa17.96■□□□□ 0.47
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NISCH-210ENST00000488157 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
NISCH-210ENST00000488157 SLC26A8Q96RN1 970 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-210ENST00000488157 STRCP1A6NGW2 1772 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-210ENST00000488157 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
NISCH-210ENST00000488157 BCANQ96GW7 911 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-210ENST00000488157 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.91■□□□□ 0.46
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NISCH-210ENST00000488157 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-210ENST00000488157 TMEM94Q12767 1356 aa17.73■□□□□ 0.43
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NISCH-210ENST00000488157 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
NISCH-210ENST00000488157 STK26Q9P289 416 aa17.63■□□□□ 0.41
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NISCH-210ENST00000488157 C14orf37Q86TY3 774 aa17.61■□□□□ 0.41
NISCH-210ENST00000488157 L3MBTL2Q969R5 705 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-210ENST00000488157 MSH6P52701 1360 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-210ENST00000488157 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
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NISCH-210ENST00000488157 C19orf44Q9H6X5 657 aa17.57■□□□□ 0.4
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NISCH-210ENST00000488157 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 ABCC11Q96J66 1382 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 ADGRB1O14514 1584 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 STAC3Q96MF2 364 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 HSPA1LP34931 641 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 SLAIN2Q9P270 581 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 TECPR2O15040 1411 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 ATF3P18847 181 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 NBPF1Q3BBV0 1214 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-210ENST00000488157 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 TRAK1Q9UPV9 953 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 FAM135BQ49AJ0 1406 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 PRAM1Q96QH2 718 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 NBPF8Q3BBV2 869 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 DCCP43146 1447 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-210ENST00000488157 MST1RQ04912 1400 aa17.47■□□□□ 0.39
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