RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 CLTCL1P53675 1640 aa25.77■■□□□ 1.72
CLDN11-202ENST00000468358 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.76■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 ZFYVE9O95405 1425 aa25.75■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 KIF1BO60333 1816 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 CPS1P31327 1500 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 FOXD1Q16676 465 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.72■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.72■■□□□ 1.71
CLDN11-202ENST00000468358 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.69■■□□□ 1.7
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CLDN11-202ENST00000468358 TBX22Q9Y458 520 aa25.55■■□□□ 1.68
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CLDN11-202ENST00000468358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CLDN11-202ENST00000468358 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CLDN11-202ENST00000468358 NWD1Q149M9 1564 aa25.53■■□□□ 1.68
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CLDN11-202ENST00000468358 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.5■■□□□ 1.67
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CLDN11-202ENST00000468358 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CLDN11-202ENST00000468358 TMEM94Q12767 1356 aa25.48■■□□□ 1.67
CLDN11-202ENST00000468358 PIP4K2BP78356 416 aa25.48■■□□□ 1.67
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CLDN11-202ENST00000468358 PIK3R4Q99570 1358 aa25.46■■□□□ 1.67
CLDN11-202ENST00000468358 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.46■■□□□ 1.67
CLDN11-202ENST00000468358 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.42■■□□□ 1.66
CLDN11-202ENST00000468358 IFT172Q9UG01 1749 aa25.41■■□□□ 1.66
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.41■■□□□ 1.66
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CLDN11-202ENST00000468358 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CLDN11-202ENST00000468358 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.36■■□□□ 1.65
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CLDN11-202ENST00000468358 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.29■■□□□ 1.64
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CLDN11-202ENST00000468358 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.24■■□□□ 1.63
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CLDN11-202ENST00000468358 PTCH1Q13635 1447 aa25.21■■□□□ 1.63
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CLDN11-202ENST00000468358 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.19■■□□□ 1.62
CLDN11-202ENST00000468358 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.19■■□□□ 1.62
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CLDN11-202ENST00000468358 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.18■■□□□ 1.62
CLDN11-202ENST00000468358 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.18■■□□□ 1.62
CLDN11-202ENST00000468358 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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CLDN11-202ENST00000468358 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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CLDN11-202ENST00000468358 STAC3Q96MF2 364 aa25.12■■□□□ 1.61
CLDN11-202ENST00000468358 ABCC11Q96J66 1382 aa25.1■■□□□ 1.61
CLDN11-202ENST00000468358 TECPR2O15040 1411 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLDN11-202ENST00000468358 PHLPP1O60346 1717 aa25.08■■□□□ 1.61
CLDN11-202ENST00000468358 MST1RQ04912 1400 aa25.07■■□□□ 1.6
CLDN11-202ENST00000468358 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.05■■□□□ 1.6
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CLDN11-202ENST00000468358 ADGRB1O14514 1584 aa25.02■■□□□ 1.6
CLDN11-202ENST00000468358 BRINP3Q76B58 766 aa25.02■■□□□ 1.6
CLDN11-202ENST00000468358 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CLDN11-202ENST00000468358 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN11-202ENST00000468358 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.01■■□□□ 1.59
CLDN11-202ENST00000468358 POGKQ9P215 609 aa25■■□□□ 1.59
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