RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM52Q96A61 297 aa23.42■■□□□ 1.34
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.41■■□□□ 1.34
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.38■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCANQ96GW7 911 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRPM2O94759 1503 aa23.37■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLTCL1P53675 1640 aa23.35■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOM1O60784 492 aa23.32■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNA6P17658 529 aa23.31■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NWD1Q149M9 1564 aa23.31■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALKQ9UM73 1620 aa23.3■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIP4K2BP78356 416 aa23.29■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.27■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DIP2AQ14689 1571 aa23.26■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF1BO60333 1816 aa23.26■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.25■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBX22Q9Y458 520 aa23.25■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM94Q12767 1356 aa23.25■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXD1Q16676 465 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIK3R4Q99570 1358 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSPA1LP34931 641 aa23.17■■□□□ 1.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.15■■□□□ 1.3
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPRUQ92729 1446 aa23.14■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSH6P52701 1360 aa23.11■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPLO60437 1756 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 METP08581 1390 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C14orf37Q86TY3 774 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RGL3Q3MIN7 710 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.03■■□□□ 1.28
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFT172Q9UG01 1749 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C19orf44Q9H6X5 657 aa23■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLAIN2Q9P270 581 aa23■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HRCP23327 699 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.98■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.96■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATF3P18847 181 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTCH1Q13635 1447 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCCP43146 1447 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIK3C2GO75747 1445 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHLPP1O60346 1717 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYOM2P54296 1465 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MST1RQ04912 1400 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRINP3Q76B58 766 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STK26Q9P289 416 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TECPR2O15040 1411 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAMC1P11047 1609 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.79■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCC11Q96J66 1382 aa22.78■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 JCADQ9P266 1359 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms