RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 ZFYVE9O95405 1425 aa27.53■■■□□ 2
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CXorf40A-210ENST00000448332 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
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CXorf40A-210ENST00000448332 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.49■■□□□ 1.99
CXorf40A-210ENST00000448332 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.49■■□□□ 1.99
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CXorf40A-210ENST00000448332 KIF1BO60333 1816 aa27.42■■□□□ 1.98
CXorf40A-210ENST00000448332 DIP2AQ14689 1571 aa27.41■■□□□ 1.98
CXorf40A-210ENST00000448332 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CXorf40A-210ENST00000448332 NWD1Q149M9 1564 aa27.4■■□□□ 1.98
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CXorf40A-210ENST00000448332 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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CXorf40A-210ENST00000448332 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.33■■□□□ 1.97
CXorf40A-210ENST00000448332 TBX22Q9Y458 520 aa27.32■■□□□ 1.96
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CXorf40A-210ENST00000448332 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.3■■□□□ 1.96
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CXorf40A-210ENST00000448332 PIK3R4Q99570 1358 aa27.28■■□□□ 1.96
CXorf40A-210ENST00000448332 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.27■■□□□ 1.96
CXorf40A-210ENST00000448332 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.27■■□□□ 1.96
CXorf40A-210ENST00000448332 FOXD1Q16676 465 aa27.26■■□□□ 1.95
CXorf40A-210ENST00000448332 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.26■■□□□ 1.95
CXorf40A-210ENST00000448332 MSH6P52701 1360 aa27.25■■□□□ 1.95
CXorf40A-210ENST00000448332 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.24■■□□□ 1.95
CXorf40A-210ENST00000448332 HSPA1LP34931 641 aa27.23■■□□□ 1.95
CXorf40A-210ENST00000448332 C14orf37Q86TY3 774 aa27.23■■□□□ 1.95
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CXorf40A-210ENST00000448332 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.22■■□□□ 1.95
CXorf40A-210ENST00000448332 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.21■■□□□ 1.95
CXorf40A-210ENST00000448332 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.18■■□□□ 1.94
CXorf40A-210ENST00000448332 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CXorf40A-210ENST00000448332 PPLO60437 1756 aa27.17■■□□□ 1.94
CXorf40A-210ENST00000448332 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.16■■□□□ 1.94
CXorf40A-210ENST00000448332 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CXorf40A-210ENST00000448332 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.15■■□□□ 1.94
CXorf40A-210ENST00000448332 PTPRUQ92729 1446 aa27.12■■□□□ 1.93
CXorf40A-210ENST00000448332 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.11■■□□□ 1.93
CXorf40A-210ENST00000448332 METP08581 1390 aa27.1■■□□□ 1.93
CXorf40A-210ENST00000448332 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.09■■□□□ 1.93
CXorf40A-210ENST00000448332 RGL3Q3MIN7 710 aa27.09■■□□□ 1.93
CXorf40A-210ENST00000448332 ATF3P18847 181 aa27.07■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.06■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.06■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 IFT172Q9UG01 1749 aa27.05■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.05■■□□□ 1.92
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CXorf40A-210ENST00000448332 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.04■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 SLAIN2Q9P270 581 aa27.04■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CXorf40A-210ENST00000448332 DCCP43146 1447 aa27■■□□□ 1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 PTCH1Q13635 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 HRCP23327 699 aa26.98■■□□□ 1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 PHLPP1O60346 1717 aa26.98■■□□□ 1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.97■■□□□ 1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.96■■□□□ 1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.96■■□□□ 1.91
CXorf40A-210ENST00000448332 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CXorf40A-210ENST00000448332 PIK3C2GO75747 1445 aa26.92■■□□□ 1.9
CXorf40A-210ENST00000448332 MYOM2P54296 1465 aa26.91■■□□□ 1.9
CXorf40A-210ENST00000448332 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.9■■□□□ 1.9
CXorf40A-210ENST00000448332 LAMC1P11047 1609 aa26.9■■□□□ 1.9
CXorf40A-210ENST00000448332 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.89■■□□□ 1.9
CXorf40A-210ENST00000448332 MST1RQ04912 1400 aa26.86■■□□□ 1.89
CXorf40A-210ENST00000448332 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CXorf40A-210ENST00000448332 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.85■■□□□ 1.89
CXorf40A-210ENST00000448332 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.85■■□□□ 1.89
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CXorf40A-210ENST00000448332 STK26Q9P289 416 aa26.84■■□□□ 1.89
CXorf40A-210ENST00000448332 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 JCADQ9P266 1359 aa26.83■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.82■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 BRINP3Q76B58 766 aa26.82■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 TECPR2O15040 1411 aa26.81■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 ILDR2Q71H61 639 aa26.8■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.79■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.79■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CXorf40A-210ENST00000448332 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.76■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 ABCC11Q96J66 1382 aa26.76■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.75■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.75■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.75■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.75■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 SHPRHQ149N8 1683 aa26.73■■□□□ 1.87
CXorf40A-210ENST00000448332 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.71■■□□□ 1.87
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