RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.66■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 ZFYVE9O95405 1425 aa31.66■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.65■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 TRIM52Q96A61 297 aa31.63■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.62■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.61■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 KCNA6P17658 529 aa31.57■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 PIP4K2BP78356 416 aa31.56■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 TRPM2O94759 1503 aa31.54■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 NWD1Q149M9 1564 aa31.49■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 DIP2AQ14689 1571 aa31.48■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 TBX22Q9Y458 520 aa31.48■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 KIF1BO60333 1816 aa31.47■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 CLTCL1P53675 1640 aa31.46■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
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LTB-211ENST00000446745 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 ALKQ9UM73 1620 aa31.42■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 PIK3R4Q99570 1358 aa31.42■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.4■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 HSPA1LP34931 641 aa31.38■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.35■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.34■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 MSH6P52701 1360 aa31.34■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.33■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.32■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.31■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.3■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
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LTB-211ENST00000446745 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.27■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.27■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 C14orf37Q86TY3 774 aa31.26■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 FOXD1Q16676 465 aa31.25■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.25■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.24■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.18■■■□□ 2.58
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LTB-211ENST00000446745 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 PPLO60437 1756 aa31.17■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.16■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.16■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 SLAIN2Q9P270 581 aa31.16■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.15■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 METP08581 1390 aa31.15■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 ATF3P18847 181 aa31.14■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.09■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.08■■■□□ 2.57
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LTB-211ENST00000446745 IFT172Q9UG01 1749 aa31.03■■■□□ 2.56
LTB-211ENST00000446745 PTCH1Q13635 1447 aa31.01■■■□□ 2.55
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LTB-211ENST00000446745 PHLPP1O60346 1717 aa31■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.98■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.98■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.97■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 ILDR2Q71H61 639 aa30.96■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.93■■■□□ 2.54
LTB-211ENST00000446745 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.91■■■□□ 2.54
LTB-211ENST00000446745 PIK3C2GO75747 1445 aa30.9■■■□□ 2.54
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LTB-211ENST00000446745 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.81■■■□□ 2.52
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LTB-211ENST00000446745 ABCC11Q96J66 1382 aa30.79■■■□□ 2.52
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LTB-211ENST00000446745 STAC3Q96MF2 364 aa30.77■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.75■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 SHPRHQ149N8 1683 aa30.74■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.72■■■□□ 2.51
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