RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CUX1P39880 1505 aa7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.94□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERBB3P21860 1342 aa7.94□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.94□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL27Q8NEV9 243 aa7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSKSQ9UJT2 592 aa7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCC8Q09428 1581 aa7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 OATP04181 439 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLRP7Q8WX94 980 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK17Q96T54 332 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM117AQ9C073 453 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf80F5H4A9 247 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSEN2P49810 448 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNJ1O43426 1573 aa7.9□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.9□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 PROX2Q3B8N5 592 aa7.9□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.9□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 MS4A1P11836 297 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLCN1P35523 988 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 EYA1Q99502 592 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP33O14559 1287 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNMA3Q9UL41 463 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOP2BQ02880 1626 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.86□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.86□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 TATDN2Q93075 761 aa7.86□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.86□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNH8Q96L42 1107 aa7.86□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCCD1A6NED2 376 aa7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBPF26B4DH59 902 aa7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMAPO00193 183 aa7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 PACS2Q86VP3 889 aa7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF11O15085 1522 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOGA1O94964 1423 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTS12P58397 1594 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP54-201ENST00000435535 PBX2P40425 430 aa7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJB2P25686 324 aa7.81□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.81□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.81□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRIN2BQ13224 1484 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.79□□□□□ -1.16
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP170Q5SW79 1584 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNJ2O15056 1496 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARAP1Q96P48 1450 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.76□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD46P15529 392 aa7.76□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOPCQ9HD26 462 aa7.76□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 TK2O00142 265 aa7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULF1Q8IWU6 871 aa7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRIN2AQ12879 1464 aa7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.73□□□□□ -1.17
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