RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ALKQ9UM73 1620 aa24.66■■□□□ 1.54
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HFM1A2PYH4 1435 aa24.65■■□□□ 1.54
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCANQ96GW7 911 aa24.63■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KCNA6P17658 529 aa24.62■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.62■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.61■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRIM52Q96A61 297 aa24.59■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HSPA1LP34931 641 aa24.58■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM94Q12767 1356 aa24.54■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBX22Q9Y458 520 aa24.54■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NWD1Q149M9 1564 aa24.53■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLTCL1P53675 1640 aa24.53■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.52■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.51■■□□□ 1.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRPM2O94759 1503 aa24.51■■□□□ 1.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FOXD1Q16676 465 aa24.45■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF1BO60333 1816 aa24.44■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DIP2AQ14689 1571 aa24.43■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.43■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.41■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTPRUQ92729 1446 aa24.41■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PIK3R4Q99570 1358 aa24.41■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.39■■□□□ 1.5
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ILDR2Q71H61 639 aa24.39■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.39■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.38■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MSH6P52701 1360 aa24.37■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.36■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 METP08581 1390 aa24.35■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.35■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.33■■□□□ 1.49
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLAIN2Q9P270 581 aa24.32■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.31■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C14orf37Q86TY3 774 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.3■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.28■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.28■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.27■■□□□ 1.48
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPLO60437 1756 aa24.26■■□□□ 1.47
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RGL3Q3MIN7 710 aa24.24■■□□□ 1.47
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.23■■□□□ 1.47
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.22■■□□□ 1.47
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATF3P18847 181 aa24.21■■□□□ 1.47
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.2■■□□□ 1.46
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PHLPP1O60346 1717 aa24.16■■□□□ 1.46
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IFT172Q9UG01 1749 aa24.15■■□□□ 1.46
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.14■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DCCP43146 1447 aa24.13■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BRINP3Q76B58 766 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SOCS7O14512 581 aa24.11■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MST1RQ04912 1400 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTCH1Q13635 1447 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HRCP23327 699 aa24.09■■□□□ 1.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.08■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 JCADQ9P266 1359 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PIK3C2GO75747 1445 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 STK26Q9P289 416 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.99■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC11Q96J66 1382 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TECPR2O15040 1411 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYOM2P54296 1465 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ORAI2Q96SN7 254 aa23.97■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SHPRHQ149N8 1683 aa23.94■■□□□ 1.42
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