RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
HERC3-205ENST00000426683 HRCP23327 699 aa26.71■■□□□ 1.87
HERC3-205ENST00000426683 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
HERC3-205ENST00000426683 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 BCANQ96GW7 911 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.67■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 FBXO41Q8TF61 875 aa26.65■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.65■■□□□ 1.86
HERC3-205ENST00000426683 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.64■■□□□ 1.85
HERC3-205ENST00000426683 CPS1P31327 1500 aa26.63■■□□□ 1.85
HERC3-205ENST00000426683 KIF1BO60333 1816 aa26.62■■□□□ 1.85
HERC3-205ENST00000426683 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
HERC3-205ENST00000426683 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.57■■□□□ 1.84
HERC3-205ENST00000426683 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.55■■□□□ 1.84
HERC3-205ENST00000426683 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HERC3-205ENST00000426683 TBX22Q9Y458 520 aa26.54■■□□□ 1.84
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.54■■□□□ 1.84
HERC3-205ENST00000426683 KCNA6P17658 529 aa26.53■■□□□ 1.84
HERC3-205ENST00000426683 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.53■■□□□ 1.84
HERC3-205ENST00000426683 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 RGL3Q3MIN7 710 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 DIP2AQ14689 1571 aa26.49■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.48■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.46■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 NWD1Q149M9 1564 aa26.46■■□□□ 1.83
HERC3-205ENST00000426683 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.45■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 PIK3R4Q99570 1358 aa26.44■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 PPLO60437 1756 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 TMEM94Q12767 1356 aa26.4■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HERC3-205ENST00000426683 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.39■■□□□ 1.81
HERC3-205ENST00000426683 METP08581 1390 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC3-205ENST00000426683 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC3-205ENST00000426683 PTPRUQ92729 1446 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC3-205ENST00000426683 TOM1O60784 492 aa26.37■■□□□ 1.81
HERC3-205ENST00000426683 IFT172Q9UG01 1749 aa26.34■■□□□ 1.81
HERC3-205ENST00000426683 ALKQ9UM73 1620 aa26.33■■□□□ 1.81
HERC3-205ENST00000426683 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
HERC3-205ENST00000426683 PIP4K2BP78356 416 aa26.31■■□□□ 1.8
HERC3-205ENST00000426683 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
HERC3-205ENST00000426683 PIK3C2GO75747 1445 aa26.29■■□□□ 1.8
HERC3-205ENST00000426683 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
HERC3-205ENST00000426683 MYOM2P54296 1465 aa26.28■■□□□ 1.8
HERC3-205ENST00000426683 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
HERC3-205ENST00000426683 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.26■■□□□ 1.79
HERC3-205ENST00000426683 MSH6P52701 1360 aa26.26■■□□□ 1.79
HERC3-205ENST00000426683 C14orf37Q86TY3 774 aa26.26■■□□□ 1.79
HERC3-205ENST00000426683 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HERC3-205ENST00000426683 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.24■■□□□ 1.79
HERC3-205ENST00000426683 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.24■■□□□ 1.79
HERC3-205ENST00000426683 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.23■■□□□ 1.79
HERC3-205ENST00000426683 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.19■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.19■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 PTCH1Q13635 1447 aa26.18■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 STAC3Q96MF2 364 aa26.18■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.18■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.18■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.17■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.17■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.16■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 STK26Q9P289 416 aa26.16■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.14■■□□□ 1.78
HERC3-205ENST00000426683 ATF3P18847 181 aa26.13■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 LAMC1P11047 1609 aa26.13■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 HSPA1LP34931 641 aa26.12■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 NEUROD1Q13562 356 aa26.12■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.12■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 SLAIN2Q9P270 581 aa26.12■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.11■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 ABCC11Q96J66 1382 aa26.1■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 TECPR2O15040 1411 aa26.1■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.1■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 DCCP43146 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
HERC3-205ENST00000426683 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.06■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.05■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.05■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.05■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 ADGRB1O14514 1584 aa26.04■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.03■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.03■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 SIRT1Q96EB6 747 aa26.02■■□□□ 1.76
HERC3-205ENST00000426683 MST1RQ04912 1400 aa26■■□□□ 1.75
HERC3-205ENST00000426683 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.98■■□□□ 1.75
HERC3-205ENST00000426683 PRAM1Q96QH2 718 aa25.97■■□□□ 1.75
HERC3-205ENST00000426683 DLC1Q96QB1 1528 aa25.96■■□□□ 1.75
HERC3-205ENST00000426683 BRINP3Q76B58 766 aa25.95■■□□□ 1.74
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