RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 TRPM2O94759 1503 aa23.39■■□□□ 1.34
SPC24-201ENST00000423327 NWD1Q149M9 1564 aa23.39■■□□□ 1.33
SPC24-201ENST00000423327 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.39■■□□□ 1.33
SPC24-201ENST00000423327 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.38■■□□□ 1.33
SPC24-201ENST00000423327 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SPC24-201ENST00000423327 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SPC24-201ENST00000423327 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.33■■□□□ 1.33
SPC24-201ENST00000423327 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SPC24-201ENST00000423327 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.31■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 TRIM52Q96A61 297 aa23.31■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 KCNA6P17658 529 aa23.3■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.28■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 DIP2AQ14689 1571 aa23.28■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 TOM1O60784 492 aa23.28■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 TMEM94Q12767 1356 aa23.27■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 KIF1BO60333 1816 aa23.27■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 PIP4K2BP78356 416 aa23.27■■□□□ 1.32
SPC24-201ENST00000423327 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 BCANQ96GW7 911 aa23.25■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.25■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 TBX22Q9Y458 520 aa23.23■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 FOXD1Q16676 465 aa23.22■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 HSPA1LP34931 641 aa23.21■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 PTPRUQ92729 1446 aa23.21■■□□□ 1.31
SPC24-201ENST00000423327 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.2■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 PIK3R4Q99570 1358 aa23.17■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.16■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 PPLO60437 1756 aa23.16■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.14■■□□□ 1.3
SPC24-201ENST00000423327 METP08581 1390 aa23.13■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.1■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.1■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.09■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.09■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.08■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.08■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 IFT172Q9UG01 1749 aa23.08■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.08■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 MSH6P52701 1360 aa23.08■■□□□ 1.29
SPC24-201ENST00000423327 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SPC24-201ENST00000423327 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SPC24-201ENST00000423327 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.05■■□□□ 1.28
SPC24-201ENST00000423327 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.99■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.99■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 ILDR2Q71H61 639 aa22.98■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 SLAIN2Q9P270 581 aa22.98■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.98■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 RGL3Q3MIN7 710 aa22.97■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 PTCH1Q13635 1447 aa22.97■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.97■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.96■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 DCCP43146 1447 aa22.96■■□□□ 1.27
SPC24-201ENST00000423327 C14orf37Q86TY3 774 aa22.95■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 PIK3C2GO75747 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.94■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.94■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.94■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 PHLPP1O60346 1717 aa22.94■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 MST1RQ04912 1400 aa22.91■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 HRCP23327 699 aa22.91■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.91■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.91■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPC24-201ENST00000423327 MYOM2P54296 1465 aa22.89■■□□□ 1.25
SPC24-201ENST00000423327 ATF3P18847 181 aa22.88■■□□□ 1.25
SPC24-201ENST00000423327 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.86■■□□□ 1.25
SPC24-201ENST00000423327 TECPR2O15040 1411 aa22.85■■□□□ 1.25
SPC24-201ENST00000423327 BRINP3Q76B58 766 aa22.85■■□□□ 1.25
SPC24-201ENST00000423327 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.82■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 LAMC1P11047 1609 aa22.81■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.8■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.79■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.79■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 ABCC11Q96J66 1382 aa22.78■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.78■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 JCADQ9P266 1359 aa22.77■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 SHPRHQ149N8 1683 aa22.77■■□□□ 1.24
SPC24-201ENST00000423327 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.76■■□□□ 1.23
SPC24-201ENST00000423327 STK26Q9P289 416 aa22.76■■□□□ 1.23
SPC24-201ENST00000423327 ADGRB1O14514 1584 aa22.76■■□□□ 1.23
SPC24-201ENST00000423327 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SPC24-201ENST00000423327 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SPC24-201ENST00000423327 LRP6O75581 1613 aa22.75■■□□□ 1.23
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