RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419542.3

PCBP1-AS1-214, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 1,309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.05■□□□□ 0.96
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.04■□□□□ 0.96
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.04■□□□□ 0.96
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.03■□□□□ 0.96
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZFYVE9O95405 1425 aa21.02■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TRPM2O94759 1503 aa21.01■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CLTCL1P53675 1640 aa21■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CPS1P31327 1500 aa20.98■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.97■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KIF1BO60333 1816 aa20.96■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.96■□□□□ 0.95
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.95■□□□□ 0.94
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.94■□□□□ 0.94
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KCNA6P17658 529 aa20.9■□□□□ 0.94
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.9■□□□□ 0.94
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.89■□□□□ 0.94
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TBX22Q9Y458 520 aa20.89■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HRCP23327 699 aa20.88■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RGL3Q3MIN7 710 aa20.87■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.86■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.85■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TOM1O60784 492 aa20.85■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PIP4K2BP78356 416 aa20.84■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.82■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TMEM94Q12767 1356 aa20.81■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DIP2AQ14689 1571 aa20.81■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.79■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NWD1Q149M9 1564 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PPLO60437 1756 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.78■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PIK3R4Q99570 1358 aa20.77■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 METP08581 1390 aa20.76■□□□□ 0.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.75■□□□□ 0.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PTPRUQ92729 1446 aa20.75■□□□□ 0.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 C14orf37Q86TY3 774 aa20.75■□□□□ 0.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.74■□□□□ 0.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ALKQ9UM73 1620 aa20.72■□□□□ 0.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MSH6P52701 1360 aa20.7■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 IFT172Q9UG01 1749 aa20.68■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HSPA1LP34931 641 aa20.68■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.65■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.64■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.64■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.63■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SLAIN2Q9P270 581 aa20.63■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ATF3P18847 181 aa20.62■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.62■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 STK26Q9P289 416 aa20.62■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PIK3C2GO75747 1445 aa20.61■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.59■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.59■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.58■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MYOM2P54296 1465 aa20.58■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.57■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.55■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.55■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PTCH1Q13635 1447 aa20.54■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.53■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.53■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NEUROD1Q13562 356 aa20.53■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.53■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.52■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 STAC3Q96MF2 364 aa20.52■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.51■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DCCP43146 1447 aa20.5■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCC11Q96J66 1382 aa20.5■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.49■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 LAMC1P11047 1609 aa20.49■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TECPR2O15040 1411 aa20.47■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.46■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.46■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BRINP3Q76B58 766 aa20.46■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MST1RQ04912 1400 aa20.46■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.45■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.45■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PHLPP1O60346 1717 aa20.44■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.44■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PRAM1Q96QH2 718 aa20.43■□□□□ 0.86
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms