RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 H3BQV1 296 aa24.93■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 IFFO2Q5TF58 517 aa24.93■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.93■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 MIA2Q96PC5 1412 aa24.91■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 GNAI1P63096 354 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 PSME1Q06323 249 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 ROCK1Q13464 1354 aa24.9■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.89■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A3P48751 1232 aa24.87■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.86■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 MARCH6O60337 910 aa24.86■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 AAMPQ13685 434 aa24.86■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 NCAPD3P42695 1498 aa24.85■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 KIF21BO75037 1637 aa24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.84■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.83■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.83■■□□□ 1.57
CCSAP-203ENST00000366687 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.82■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 NECTIN2Q92692 538 aa24.82■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 NCOA2Q15596 1464 aa24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 TPM3P06753 285 aa24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.561e-7■■■■□ 24.2
CCSAP-203ENST00000366687 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 BECN2A8MW95 431 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 RNF20Q5VTR2 975 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 HMOX1P09601 288 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.78■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 GSE1Q14687 1217 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 AFAP1Q8N556 730 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.77■■□□□ 1.56
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 MCTP1Q6DN14 999 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 CABP2Q9NPB3 220 aa24.76■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.75■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 MTHFSP49914 203 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 VPS53Q5VIR6 699 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 LNPKQ9C0E8 428 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 CPLX1O14810 134 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.74■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 ARID3AQ99856 593 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 TRDNQ13061 729 aa24.73■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM29Q14134 588 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 ERC2O15083 957 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 APPP05067 770 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 GRIN2BQ13224 1484 aa24.72■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 CEP89Q96ST8 783 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP6P59044 892 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.71■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
CCSAP-203ENST00000366687 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.7■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 ATF3P18847 181 aa24.69■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 PANK1Q8TE04 598 aa24.69■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 HFM1A2PYH4 1435 aa24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 NUCB2P80303 420 aa24.68■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 TPM1P09493 284 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 VPS37DQ86XT2 251 aa24.67■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 SYNJ2O15056 1496 aa24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.66■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.64■■□□□ 1.54
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R1AP30153 589 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 ARAP1Q96P48 1450 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 MSH5O43196 834 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.64■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 TPM2P07951 284 aa24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 BICD2Q8TD16 824 aa24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms