RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
SYF2-201ENST00000236273 KIF1BO60333 1816 aa32.98■■■□□ 2.87
SYF2-201ENST00000236273 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
SYF2-201ENST00000236273 HDGFP51858 240 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 CERKQ8TCT0 537 aa32.94■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.93■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.92■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.92■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa32.9■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.89■■■□□ 2.86
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.88■■■□□ 2.85
SYF2-201ENST00000236273 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.87■■■□□ 2.85
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
SYF2-201ENST00000236273 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.84■■■□□ 2.85
SYF2-201ENST00000236273 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.82■■■□□ 2.84
SYF2-201ENST00000236273 TBX22Q9Y458 520 aa32.8■■■□□ 2.84
SYF2-201ENST00000236273 BCANQ96GW7 911 aa32.79■■■□□ 2.84
SYF2-201ENST00000236273 RGL3Q3MIN7 710 aa32.78■■■□□ 2.84
SYF2-201ENST00000236273 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.78■■■□□ 2.84
SYF2-201ENST00000236273 CPS1P31327 1500 aa32.78■■■□□ 2.84
SYF2-201ENST00000236273 PPLO60437 1756 aa32.77■■■□□ 2.84
SYF2-201ENST00000236273 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.75■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 KCNA6P17658 529 aa32.74■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.73■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 VGFO15240 615 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 LRRC7Q96NW7 1537 aa32.7■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 IFT172Q9UG01 1749 aa32.7■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 DIP2AQ14689 1571 aa32.7■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
SYF2-201ENST00000236273 FBXO41Q8TF61 875 aa32.69■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 NWD1Q149M9 1564 aa32.68■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.68■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 PIK3R4Q99570 1358 aa32.65■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 PTPRUQ92729 1446 aa32.65■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 METP08581 1390 aa32.64■■■□□ 2.82
SYF2-201ENST00000236273 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
SYF2-201ENST00000236273 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
SYF2-201ENST00000236273 ALKQ9UM73 1620 aa32.59■■■□□ 2.81
SYF2-201ENST00000236273 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.56■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.56■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.55■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 PIK3C2GO75747 1445 aa32.54■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 TMEM94Q12767 1356 aa32.54■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 MYOM2P54296 1465 aa32.54■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.51■■■□□ 2.8
SYF2-201ENST00000236273 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
SYF2-201ENST00000236273 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.49■■■□□ 2.79
SYF2-201ENST00000236273 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.48■■■□□ 2.79
SYF2-201ENST00000236273 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
SYF2-201ENST00000236273 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.45■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa32.43■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 CFAP70Q5T0N1 1121 aa32.42■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 STAC3Q96MF2 364 aa32.42■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.42■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 TOM1O60784 492 aa32.4■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 TMEM132EQ6IEE7 984 aa32.4■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.4■■■□□ 2.78
SYF2-201ENST00000236273 ROBO2Q9HCK4 1378 aa32.36■■■□□ 2.77
SYF2-201ENST00000236273 NEUROD1Q13562 356 aa32.36■■■□□ 2.77
SYF2-201ENST00000236273 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.34■■■□□ 2.77
SYF2-201ENST00000236273 PTCH1Q13635 1447 aa32.34■■■□□ 2.77
SYF2-201ENST00000236273 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
SYF2-201ENST00000236273 LAMC1P11047 1609 aa32.31■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 MSH6P52701 1360 aa32.31■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 ABCC11Q96J66 1382 aa32.31■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 TECPR2O15040 1411 aa32.3■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 PIP4K2BP78356 416 aa32.29■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.29■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 ADGRB1O14514 1584 aa32.29■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 STK26Q9P289 416 aa32.28■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
SYF2-201ENST00000236273 KNDC1Q76NI1 1749 aa32.25■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 C14orf37Q86TY3 774 aa32.25■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.23■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa32.22■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 SIRT1Q96EB6 747 aa32.22■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 NALCNQ8IZF0 1738 aa32.21■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa32.2■■■□□ 2.75
SYF2-201ENST00000236273 SLAIN2Q9P270 581 aa32.2■■■□□ 2.74
SYF2-201ENST00000236273 DCCP43146 1447 aa32.18■■■□□ 2.74
SYF2-201ENST00000236273 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.18■■■□□ 2.74
SYF2-201ENST00000236273 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.18■■■□□ 2.74
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.17■■■□□ 2.74
SYF2-201ENST00000236273 ATF3P18847 181 aa32.16■■■□□ 2.74
SYF2-201ENST00000236273 NBPF1Q3BBV0 1214 aa32.16■■■□□ 2.74
SYF2-201ENST00000236273 DLC1Q96QB1 1528 aa32.13■■■□□ 2.73
SYF2-201ENST00000236273 HSPA1LP34931 641 aa32.13■■■□□ 2.73
SYF2-201ENST00000236273 TRAK1Q9UPV9 953 aa32.12■■■□□ 2.73
SYF2-201ENST00000236273 MST1RQ04912 1400 aa32.11■■■□□ 2.73
SYF2-201ENST00000236273 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms