RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
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INO80B-201ENST00000233331 CLTCL1P53675 1640 aa45.8■■■■■ 4.92
INO80B-201ENST00000233331 BCANQ96GW7 911 aa45.77■■■■■ 4.92
INO80B-201ENST00000233331 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP45.75■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa45.74■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 SLC26A8Q96RN1 970 aa45.74■■■■■ 4.91
INO80B-201ENST00000233331 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
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INO80B-201ENST00000233331 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa45.52■■■■■ 4.88
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INO80B-201ENST00000233331 TOM1O60784 492 aa45.48■■■■■ 4.87
INO80B-201ENST00000233331 CCDC144AA2RUR9 1427 aa45.48■■■■■ 4.87
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INO80B-201ENST00000233331 TMEM94Q12767 1356 aa45.41■■■■■ 4.86
INO80B-201ENST00000233331 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
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INO80B-201ENST00000233331 PIK3R4Q99570 1358 aa45.36■■■■■ 4.85
INO80B-201ENST00000233331 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa45.33■■■■■ 4.85
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INO80B-201ENST00000233331 VGFO15240 615 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
INO80B-201ENST00000233331 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa45.27■■■■■ 4.84
INO80B-201ENST00000233331 PTPRUQ92729 1446 aa45.25■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 RGL3Q3MIN7 710 aa45.23■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa45.21■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 METP08581 1390 aa45.2■■■■■ 4.83
INO80B-201ENST00000233331 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
INO80B-201ENST00000233331 MSH6P52701 1360 aa45.17■■■■■ 4.82
INO80B-201ENST00000233331 IFT172Q9UG01 1749 aa45.15■■■■■ 4.82
INO80B-201ENST00000233331 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa45.12■■■■■ 4.81
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INO80B-201ENST00000233331 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa45.11■■■■■ 4.81
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INO80B-201ENST00000233331 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa45.08■■■■■ 4.81
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INO80B-201ENST00000233331 SLAIN2Q9P270 581 aa44.9■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 ATF3P18847 181 aa44.89■■■■■ 4.78
INO80B-201ENST00000233331 CADPS2Q86UW7 1296 aa44.88■■■■■ 4.78
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INO80B-201ENST00000233331 DCCP43146 1447 aa44.84■■■■■ 4.77
INO80B-201ENST00000233331 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa44.84■■■■■ 4.77
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INO80B-201ENST00000233331 LAMC1P11047 1609 aa44.76■■■■■ 4.76
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INO80B-201ENST00000233331 CFAP70Q5T0N1 1121 aa44.71■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa44.71■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 TECPR2O15040 1411 aa44.7■■■■■ 4.75
INO80B-201ENST00000233331 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
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INO80B-201ENST00000233331 MST1RQ04912 1400 aa44.68■■■■■ 4.74
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INO80B-201ENST00000233331 PHLPP1O60346 1717 aa44.66■■■■■ 4.74
INO80B-201ENST00000233331 ABCC11Q96J66 1382 aa44.66■■■■■ 4.74
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INO80B-201ENST00000233331 WAPLQ7Z5K2 1190 aa44.58■■■■■ 4.73
INO80B-201ENST00000233331 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa44.55■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 ADGRB1O14514 1584 aa44.52■■■■■ 4.72
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INO80B-201ENST00000233331 C1orf167Q5SNV9 1468 aa44.52■■■■■ 4.72
INO80B-201ENST00000233331 SIRT1Q96EB6 747 aa44.46■■■■■ 4.71
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