RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000194894.3

Ankrd39-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa26.21■■□□□ 1.79
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Qtrt2B8ZXI1 415 aa26.2■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slain2Q8CI08 581 aa26.2■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa26.19■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26.18■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa26.18■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Asxl2Q8BZ32 1370 aa26.18■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PplQ9R269 1755 aa26.17■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Efcab6Q6P1E8 1516 aa26.16■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Arap3Q8R5G7 1538 aa26.15■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26.14■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PalldQ9ET54 1408 aa26.14■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Erich6D3Z6S9 713 aa26.14■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Map4P27546 1125 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa26.13■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cntnap1O54991 1385 aa26.12■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zranb1Q7M760 708 aa26.11■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zfp644E9QA22 1323 aa26.1■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Myom3A2ABU4 1439 aa26.09■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ildr2B5TVM2 661 aa26.09■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 NclP09405 707 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Stk24Q99KH8 431 aa26.08■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Adgrl1Q80TR1 1466 aa26.08■■□□□ 1.77
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PtprvP70289 1705 aa26.08■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 NinlQ6ZQ12 1394 aa26.07■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atp7aQ64430 1491 aa26.06■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Clstn2Q9ER65 966 aa26.04■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 MypopQ8R4U1 393 aa26.03■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Iqgap3F8VQ29 1632 aa26.03■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dmrt2Q8BG36 561 aa26.02■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tecpr2Q3UH45 1423 aa26.01■■□□□ 1.75
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Uggt1Q6P5E4 1551 aa26■■□□□ 1.75
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Slit3Q9WVB4 1523 aa26■■□□□ 1.75
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nsd2Q8BVE8 1365 aa25.99■■□□□ 1.75
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Arhgef28P97433 1693 aa25.99■■□□□ 1.75
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Lrp6O88572 1613 aa25.97■■□□□ 1.75
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atf3Q60765 181 aa25.96■■□□□ 1.75
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Zfp142G5E869 1843 aa25.95■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tarbp1E9Q368 1579 aa25.95■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ggt6Q6PDE7 497 aa25.94■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Znf526Q8BI66 675 aa25.94■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cd109Q8R422 1442 aa25.94■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Siglec1Q62230 1695 aa25.93■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Tmem94Q7TSH8 1360 aa25.93■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Mroh1E0CZ22 1640 aa25.92■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 UacaQ8CGB3 1411 aa25.92■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Sall3Q62255 1320 aa25.91■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Atp1b4Q99ME6 356 aa25.9■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa25.9■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ttll5Q8CHB8 1328 aa25.89■■□□□ 1.74
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Nwd1A6H603 1563 aa25.88■■□□□ 1.73
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rfx7F8VPJ6 1459 aa25.88■■□□□ 1.73
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 MpndQ3TV65 487 aa25.88■■□□□ 1.73
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa25.88■■□□□ 1.73
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Col14a1Q80X19 1797 aa25.85■■□□□ 1.73
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rgs17Q9QZB0 210 aa25.84■■□□□ 1.73
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dapk1Q80YE7 1442 aa25.82■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Q9D9H8 365 aa25.81■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 ErbinQ80TH2 1402 aa25.8■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Abca8aQ8K442 1620 aa25.79■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Trak1Q6PD31 939 aa25.78■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 NalcnQ8BXR5 1738 aa25.77■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 KdrP35918 1367 aa25.77■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 C3P01027 1663 aa25.77■■□□□ 1.72
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ube2uB1AUC4 352 aa25.76■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 AatkQ80YE4 1365 aa25.76■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 PtprgQ05909 1442 aa25.76■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pik3c2gO70167 1506 aa25.76■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif24Q6NWW5 1356 aa25.75■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pik3r4Q8VD65 1358 aa25.72■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 AU022751B1B0V2 589 aa25.72■■□□□ 1.71
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Shq1Q7TMX5 569 aa25.7■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Ift172Q6VH22 1749 aa25.68■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Abcc10Q8R4P9 1501 aa25.67■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Smim5Q8BT42 78 aa25.65■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 GnpatP98192 678 aa25.64■■□□□ 1.7
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa25.63■■□□□ 1.69
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa25.58■■□□□ 1.69
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Eno4Q8C042 619 aa25.57■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Emilin2Q8K482 1074 aa25.56■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa25.56■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Gm10563F6WIE4 79 aa25.55■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa25.54■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 DccP70211 1447 aa25.53■■□□□ 1.68
Ankrd39-202ENSMUST00000194894 Cps1Q8C196 1500 aa25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.8 ms