RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075017.4

Vpreb1-201, Transcript of Immunoglobulin iota chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Amigo3Q8C2S7 508 aa25.26■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tarbp1E9Q368 1579 aa25.26■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Myo3aQ8K3H5 1613 aa25.26■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fbln2P37889 1221 aa25.25■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Uggt1Q6P5E4 1551 aa25.24■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atp1b4Q99ME6 356 aa25.24■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PtprgQ05909 1442 aa25.23■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gimap5Q8BWF2 308 aa25.23■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Setd1aE9PYH6 1716 aa25.23■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Iqgap3F8VQ29 1632 aa25.23■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 ErbinQ80TH2 1402 aa25.22■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 IghaA0A0A6YXW6 389 aa25.22■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Brinp3Q499E0 766 aa25.21■■□□□ 1.63
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Evi5lH3BKQ3 813 aa25.19■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mbd5B1AYB6 1498 aa25.19■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa25.19■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 DnmbpQ6TXD4 1580 aa25.18■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PplQ9R269 1755 aa25.18■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif7B7ZNG0 1348 aa25.17■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atp7aQ64430 1491 aa25.16■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa25.16■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa25.15■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slain2Q8CI08 581 aa25.15■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Asxl2Q8BZ32 1370 aa25.15■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sall3Q62255 1320 aa25.14■■□□□ 1.62
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tns3Q5SSZ5 1440 aa25.13■■□□□ 1.61
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mroh1E0CZ22 1640 aa25.11■■□□□ 1.61
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa25.1■■□□□ 1.61
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Col18a1P39061 1774 aa25.09■■□□□ 1.61
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa25.07■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nyap1Q6PFX7 833 aa25.07■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Arhgef28P97433 1693 aa25.07■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 AatkQ80YE4 1365 aa25.06■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slit3Q9WVB4 1523 aa25.06■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atf3Q60765 181 aa25.05■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Q9D9H8 365 aa25.05■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ttll13A4Q9F6 804 aa25.03■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mphosph9A6H5Y1 991 aa25.03■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pik3c2gO70167 1506 aa25.02■■□□□ 1.6
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Shq1Q7TMX5 569 aa25.01■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Arap3Q8R5G7 1538 aa25■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abca8aQ8K442 1620 aa25■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Qtrt2B8ZXI1 415 aa24.99■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pik3r4Q8VD65 1358 aa24.98■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pik3c2aQ61194 1686 aa24.97■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 AU022751B1B0V2 589 aa24.96■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tmem94Q7TSH8 1360 aa24.95■■□□□ 1.59
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa24.95■■□□□ 1.58
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dapk1Q80YE7 1442 aa24.88■■□□□ 1.57
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pkd2O35245 966 aa24.86■■□□□ 1.57
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif21bQ9QXL1 1668 aa24.85■■□□□ 1.57
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nwd1A6H603 1563 aa24.84■■□□□ 1.57
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa24.83■■□□□ 1.57
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ggt6Q6PDE7 497 aa24.83■■□□□ 1.57
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa24.83■■□□□ 1.57
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ccer2J3QPU5 274 aa24.82■■□□□ 1.56
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slit2Q9R1B9 1521 aa24.81■■□□□ 1.56
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sema6bO54951 886 aa24.8■■□□□ 1.56
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cypt2Q6P924 180 aa24.79■■□□□ 1.56
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Col14a1Q80X19 1797 aa24.78■■□□□ 1.56
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa24.75■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Stk26Q99JT2 416 aa24.74■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 KdrP35918 1367 aa24.74■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Adgrl1Q80TR1 1466 aa24.74■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa24.73■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dmrt2Q8BG36 561 aa24.73■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc52a2Q9D8F3 450 aa24.73■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cntnap1O54991 1385 aa24.72■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Os9Q8K2C7 672 aa24.72■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm10563F6WIE4 79 aa24.71■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif24Q6NWW5 1356 aa24.7■■□□□ 1.55
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kdm2aP59997 1161 aa24.7■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Washc2Q6PGL7 1334 aa24.69■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dot1lQ6XZL8 1540 aa24.69■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Q3UJC8 639 aa24.68■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PtprvP70289 1705 aa24.68■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 MypopQ8R4U1 393 aa24.67■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Znf526Q8BI66 675 aa24.66■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cps1Q8C196 1500 aa24.66■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ift172Q6VH22 1749 aa24.64■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 NalcnQ8BXR5 1738 aa24.64■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 GnpatP98192 678 aa24.64■■□□□ 1.54
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Farp2Q91VS8 1065 aa24.63■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa24.63■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa24.63■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fan1Q69ZT1 1020 aa24.62■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kcna6Q61923 529 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.9 ms