RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 NinlQ6ZQ12 1394 aa29,64■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa29,63■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arap3Q8R5G7 1538 aa29,61■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Qtrt2B8ZXI1 415 aa29,61■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgrl1Q80TR1 1466 aa29,61■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slain2Q8CI08 581 aa29,59■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cntnap1O54991 1385 aa29,59■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ino80Q6ZPV2 1559 aa29,59■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 PalldQ9ET54 1408 aa29,58■■■□□ 2,33
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zranb1Q7M760 708 aa29,57■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa29,56■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tns3Q5SSZ5 1440 aa29,55■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa29,55■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP29,54■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ildr2B5TVM2 661 aa29,54■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Efcab6Q6P1E8 1516 aa29,54■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Asxl2Q8BZ32 1370 aa29,52■■■□□ 2,32
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp7aQ64430 1491 aa29,45■■■□□ 2,31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29,44■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myom3A2ABU4 1439 aa29,44■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tecpr2Q3UH45 1423 aa29,44■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP29,43■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 MypopQ8R4U1 393 aa29,43■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 PplQ9R269 1755 aa29,42■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dmrt2Q8BG36 561 aa29,41■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 PtprvP70289 1705 aa29,4■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Erich6D3Z6S9 713 aa29,4■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrp6O88572 1613 aa29,4■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP29,39■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slit3Q9WVB4 1523 aa29,39■■■□□ 2,3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Uggt1Q6P5E4 1551 aa29,36■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp644E9QA22 1323 aa29,36■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 NclP09405 707 aaKnown RBP29,35■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf526Q8BI66 675 aa29,35■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stk24Q99KH8 431 aa29,35■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Clstn2Q9ER65 966 aa29,35■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Siglec1Q62230 1695 aa29,34■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nsd2Q8BVE8 1365 aa29,34■■■□□ 2,29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP29,32■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atf3Q60765 181 aa29,31■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tarbp1E9Q368 1579 aa29,3■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa29,3■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Iqgap3F8VQ29 1632 aa29,3■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arhgef28P97433 1693 aa29,28■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem94Q7TSH8 1360 aa29,27■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ggt6Q6PDE7 497 aa29,27■■■□□ 2,28
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP29,26■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rgs17Q9QZB0 210 aa29,26■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dapk1Q80YE7 1442 aa29,25■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nwd1A6H603 1563 aa29,25■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mroh1E0CZ22 1640 aa29,24■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cd109Q8R422 1442 aa29,24■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 MpndQ3TV65 487 aa29,23■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 UacaQ8CGB3 1411 aa29,22■■■□□ 2,27
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP29,2■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sall3Q62255 1320 aa29,2■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rfx7F8VPJ6 1459 aa29,19■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 KdrP35918 1367 aa29,19■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttll5Q8CHB8 1328 aa29,18■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp142G5E869 1843 aa29,17■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa29,17■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP29,17■■■□□ 2,26
Ltb-201ENSMUST00000025262 PtprgQ05909 1442 aa29,11■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif24Q6NWW5 1356 aa29,11■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pik3r4Q8VD65 1358 aa29,11■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp1b4Q99ME6 356 aa29,1■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP29,1■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abcc10Q8R4P9 1501 aa29,1■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q9D9H8 365 aa29,09■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 ErbinQ80TH2 1402 aa29,09■■■□□ 2,25
Ltb-201ENSMUST00000025262 AatkQ80YE4 1365 aa29,07■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col14a1Q80X19 1797 aa29,06■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pik3c2gO70167 1506 aa29,04■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP29,04■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abca8aQ8K442 1620 aa29,04■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 C3P01027 1663 aa29,03■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 AU022751B1B0V2 589 aa29,03■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trak1Q6PD31 939 aa29,02■■■□□ 2,24
Ltb-201ENSMUST00000025262 NalcnQ8BXR5 1738 aa29■■■□□ 2,23
Ltb-201ENSMUST00000025262 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP28,98■■■□□ 2,23
Ltb-201ENSMUST00000025262 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP28,97■■■□□ 2,23
Ltb-201ENSMUST00000025262 Shq1Q7TMX5 569 aa28,96■■■□□ 2,23
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smim5Q8BT42 78 aa28,95■■■□□ 2,22
Ltb-201ENSMUST00000025262 GnpatP98192 678 aa28,92■■■□□ 2,22
Ltb-201ENSMUST00000025262 Emilin2Q8K482 1074 aa28,92■■■□□ 2,22
Ltb-201ENSMUST00000025262 DccP70211 1447 aa28,92■■■□□ 2,22
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa28,92■■■□□ 2,22
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa28,88■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col22a1E9Q7P1 1613 aa28,87■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP28,87■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ube2uB1AUC4 352 aa28,86■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tex14Q7M6U3 1450 aa28,85■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP28,85■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10563F6WIE4 79 aa28,83■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eno4Q8C042 619 aa28,83■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ift172Q6VH22 1749 aa28,83■■■□□ 2,21
Ltb-201ENSMUST00000025262 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa28,82■■■□□ 2,2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa28,81■■■□□ 2,2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cps1Q8C196 1500 aa28,8■■■□□ 2,2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP28,79■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,5 ms