RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PBP1P53297 722 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W MSO1P53604 210 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W ISA2Q12425 185 aa9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ARF1P11076 181 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W MDH2P22133 377 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W VMA3P25515 160 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ERG2P32352 222 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W UPS2P35200 230 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SHR5P41912 237 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ATG27P46989 271 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W OST3P48439 350 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HOL1P53389 586 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YNR014WP53719 212 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W RSM23Q01163 450 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ATC1Q04005 294 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ATG5Q12380 294 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HMS1Q12398 434 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YCL001W-BQ96VH2 84 aa9.02□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W MXR2P25566 168 aa9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ACP1P32463 125 aa9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W MNS1P32906 549 aa9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W NSA2P40078 261 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W PRR2Q12310 699 aa9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YLR365WQ7LIF2 110 aa9.01□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ATP5P09457 212 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SPS4P09937 338 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YLL053CP0CD98 152 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W BGL2P15703 313 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YCR025CP25352 136 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HOG1P32485 435 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SEF1P34228 1148 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W RPS27BP38711 82 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HED1Q03937 162 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HPF1Q05164 967 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YLR030WQ07967 263 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YOL029CQ08187 201 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HNT3Q08702 217 aa9□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ELO2P25358 347 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W REC114P32841 428 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YCK3P39962 524 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YGR149WP48236 432 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W GIS1Q03833 894 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W CTS2Q06350 511 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W LAS17Q12446 633 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W MES1P00958 751 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SCO1P23833 295 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W VMA16P23968 213 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W AHT1P29589 182 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W OCH1P31755 480 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W MIA40P36046 403 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YDR286CQ05530 114 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W PIN3Q06449 215 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ERV2Q12284 196 aa8.99□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SPO13P23624 291 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ERV1P27882 189 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HSP150P32478 413 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YIL152WP40455 235 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W MID1P41821 548 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SPG5P42933 373 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W CTK2P46962 323 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YNR061CP53747 219 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SAE3P89114 91 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W TAD3Q9URQ3 322 aa8.98□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W ILV5P06168 395 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W SPO7P18410 259 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W PEX4P29340 183 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W EMP70P32802 667 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YKL075CP36083 450 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W TIF34P40217 347 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YGR126WP53274 230 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W APS2Q00381 147 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W DIC1Q06143 298 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YPL264CQ08980 353 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa8.97□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W CCH1P50077 2039 aa8.96□□□□□ -0.97
PRP4YPR178W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W STE4P18851 423 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W ATG15P25641 520 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W COQ3P27680 312 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PFS1P38872 237 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W YND1P40009 630 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W GAT2P40209 560 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W GLC8P41818 229 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W SEI1Q06058 285 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W PAM18Q07914 168 aa8.96□□□□□ -0.98
PRP4YPR178W REX3Q12090 404 aa8.96□□□□□ -0.98
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