RNA–Protein interactions for RNA: YOR349W

CIN1, Transcript of Tubulin folding factor D involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN1, Length 3,045 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN1	YOR349W	OXA1	P39952	402 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YDR115W	Q04598	105 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	PBA1	Q05778	276 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	IRC25	Q07951	179 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	RDI1	Q12434	202 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	IRC24	P40580	263 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	MRX11	Q03079	207 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YML108W	Q03759	105 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	MSA1	Q08471	629 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	NDD1	Q08887	554 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	CDC50	P25656	391 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	ERG2	P32352	222 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YHI9	P38765	294 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	TIM17	P39515	158 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	DYN3	Q04949	312 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YOR376W	Q08900	122 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YPL229W	Q99395	206 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	MOG1	P47123	218 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YNL184C	P53876	108 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	FDH1	Q08911	376 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	CYC2	P38909	366 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	CAT5	P41735	233 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	PRM8	P53174	237 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	ERV29	P53337	310 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	COG5	P53951	403 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	PET191	Q02772	108 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	INP1	Q03694	420 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	VHS1	Q03785	461 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	TRM10	Q12400	293 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CIN1	YOR349W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SEN2	P16658	377 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SCO1	P23833	295 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	ARO7	P32178	256 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	UPS2	P35200	230 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	VMA22	P38784	181 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	NVJ1	P38881	321 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	GGC1	P38988	300 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	AVT6	P40074	448 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	COQ5	P49017	307 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	FLC3	P53121	802 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	AIM34	Q03673	198 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	PLP1	Q04004	230 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	FIG2	P25653	1609 aa		2.59	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	PTM1	P32857	523 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	TIP20	P33891	701 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	RMD6	P39975	231 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YGL262W	P53054	175 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SUE1	Q06524	206 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YOL160W	Q08321	113 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SWI1	P09547	1314 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SIR2	P06700	562 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SNF4	P12904	322 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YBL059W	P34224	193 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YHL044W	P38727	235 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	FMP32	P43557	207 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	RPE1	P46969	238 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	UBC12	P52491	188 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	RMI1	Q02685	241 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	EPT1	P22140	391 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YDR476C	Q03362	224 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SRL1	Q08673	210 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	PPT2	Q12036	173 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YPR011C	Q12251	326 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YPS3	Q12303	508 aa		2.58	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	SMP1	P38128	452 aa		2.57	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	OPY1	P38271	328 aa		2.57	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	MHT1	Q12525	324 aa		2.57	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	HKR1	P41809	1802 aa		2.57	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	YCR023C	P25351	611 aa		2.57	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	UBC8	P28263	218 aa		2.57	□□□□□ -2
CIN1	YOR349W	CSG2	P35206	410 aa		2.57	□□□□□ -2

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